Деятельность микроорганизмов проявляется не только в разложении органического вещества и минералов.
Но и в созидании нового органического вещества микробных тел и новых минеральных соединений или в результате непосредственной аккумуляции химических элементов в телах микроорганизмов (например, накопление кремнезема диатомеями и радиоляриями, извести — фораминиферами, серы — серобактериями), или в среде их местообитания как побочных продуктов жизнедеятельности организмов. Аккумуляция элементов, сопутствующая функциональной, преимущественно окислительно-восстановительной деятельности микроорганизмов, деструкции органического вещества, проявляется в отношении многих макро — и микроэлементов. Были рассмотрены процессы накопления Fe, Mn и Аl при освобождении их из органо-металлических комплексов, карбонатов кальция при гнилостных процессах и сульфатредукции, S при окислении сероводорода тионовыми бактериями.
Геохимические эффекты этих процессов проявляются в образовании вторичных биогенных минералов в коре выветривания, почвах, донных отложениях водоемов и вторичных руд, в накоплении толщ биогенных осадочных пород.
Рассмотрим некоторые закономерности в распределении этих биогенных аккумуляций на суше и в океане.