Возбудитель — несовершенный гриб Colletotrichum lini Manns et Bolley. Поражает лен в течение всей вегетации.
Вокруг стебелька проростка появляются вдавленные ярко-оранжевые пятна или перетяжки. При сильном заражении проростки погибают. При слабом заражении на семядолях пятна ржаво-оранжевые или темно-кирпичные, переходящие в язвы. Семядоли выглядят как бы обожженными, затем они засыхают и опадают. При более позднем заражении растения отстают в росте, вследствие чего наблюдается многоярусность стеблестоя. Листья, в первую очередь нижние, покрываются бурыми расплывчатыми пятнами. На стеблях, чаще у основания, образуется мраморная пятнистость. При влажной погоде она распространяется выше, пятна на стеблях сливаются, стебель становится полностью коричневым; в этом случае поражение антракнозом напоминает фузариоз, но отличается от него тем, что стебли более мягкие. В период цветения льна возбудитель заражает чашелистики, а затем переходит на стенки коробочек и семена.
Развитию болезни способствуют повышенная влажность воздуха, температура 24…26° и кислая реакция среды.
Возбудитель сохраняется на растительных остатках и с семенами. Распространение в период вегетации идет конидиями, образующимися во влажную погоду.