Поражает преимущественно люцерну в годы с обильными осадками. Возбудитель — сумчатый гриб Pseudopeziza medicaginis Fckl из группы порядков дискомицеты. На клевере болезнь встречается реже. Вызывает ее Pseudopeziza trifolii Fckl.
На листьях появляются бурые округлые пятна, сначала мелкие, потом увеличивающиеся до 2—3 мм в диаметре. Края пятен зубчато-бахромчатые. На стеблях и бобах пятна продолговатые. В центре пятен развиваются плодовые тела — апотеции, а затем сумки с сумкоспорами, которые осуществляют как первичное, так и повторное заражение. Если формируется конидиальная стадия, она представлена пикнидами с пикноспорами.
Грибы сохраняются на растениях в виде апотециев, на которых весной созревают аскоспоры, вызывающие заражение. Развитие болезни усиливается во влажную, теплую погоду. Вредоносность бурой пятнистости заключается в преждевременном массовом опадении листьев.