Методы влияния человека на животный мир принципиально те же, что и способы влияния на растения. Воздействие может быть прямым или косвенным, сознательным или невольным.
Прямое и сознательное воздействие получает либо форму истребления животных, либо форму расширения ареала животных (завоз с целью акклиматизации), либо, наконец, форму культивирования животных, сопровождаемого искусственным их отбором и созданием новых пород. Расширение ареала происходит также и случайно (распространение крыс, домашних мышей, блох, клопов и пр.). Косвенное воздействие имеет место, когда человек изменяет ландшафт: культурная степь, культурный лес, «культурные скалы» (дома, башни, замки, колокольни) приобретают свой особый животный мир, который и по составу фауны, и по её экологическим особенностям отличается от животного мира, характеризующего естественные или мало нарушенные человеком ландшафты.
Истребление человеком отдельных видов животных шло гораздо интенсивнее, чем уничтожение видов растений, так как животные по сравнению с растениями обладают в общем меньшей способностью к воспроизводству.
Во время крестовых походов львы ещё водились в Малой Азии и Сирии; теперь их там нет. Последний волк был убит в Великобритании почти 250 лет назад. Этот хищник нацело истреблён также в Дании, Нидерландах и Швейцарии. Европейский дикий бык, или тур (Bos primigenius), исчез уже в историческое время. То же произошло с зубром и бизоном. Зубр был некогда широко распространён в Европе. Ещё Цезарь нашёл его в Германии и Бельгии, а в Польше животное было довольно обыкновенным вплоть до XVI в. В последнее же время зубра можно было встретить только в Беловежской Пуще (количество зубров здесь в 1857 г. достигало 1900 голов, но уже к 1892 г. не превышало 500), где он находился под специальной охраной, да в Кавказском заповеднике (ныне там свыше 60 зубров).
Не так давно численность бизоньих стад в Америке была колоссальной. Ещё в 1871 г. на р. Арканзасе (в штате Канзас) держалось стадо, насчитывавшее не менее 4 млн. голов: равнина на пространстве, доступном глазу, была сплошь чёрной от бизонов. Один путешественник, ехавший по железной дороге, соединяющей Тихий и Атлантический океаны, говорит, что, пересекая Арканзас, он ехал в поезде 30 географических миль (свыше 200 км) среди стада бизонов. Систематическое истребление бизонов началось с 1830 года. Когда окончена была постройка Тихоокеанской железной дороги, бизоны были ею разделены как бы на два стада: северное (к северу от дороги), которое насчитывало около 1,5 млн. голов, и южное в 4 млн. голов. В 1872—1874 гг. из южного стада было убито 3,5 млн. (за три года!), а в 1875 г. их осталось не более 10 тыс. голов. Северное стадо, разбросанное на более обширной территории, было почти целиком истреблено к 1884 г.
Раньше речные бобры водились в Европе всюду. В Великобритании они исчезли уже в XII в., в Богемии в XVIII в. В Германии бобр сохранился лишь на Эльбе. Лось во Франции исчез с 250 г. н. э., во Фландрии с X в., в Венгрии к концу XVIII в. Теперь лось весьма редок.
Бискайский кит, за которым древние баски охотились в Гасконском заливе много веков назад, исчез вовсе. Морская корова (из группы сирен, или травоядных китов) в Беринговом море, около Командорских островов, была уничтожена в XVIII в. за каких-нибудь 30 лет; во множестве водилась она и у берегов Калифорнии, но и здесь с 1868 г. её уже нет. За последние 2 тыс. лет число видов и подвидов млекопитающих на Земле уменьшилось на 72 вида, причём половина этого количества форм исчезла в течение последних 50 лет.
Только в морях всего мира (не считая рек и озёр) вылавливаются ежегодно многие миллионы тонн рыбы. Галапагосские острова некогда были населены множеством гигантских черепах самых разнообразных видов: путешественники XVII в. видели их стада в несколько тысяч. Но теперь эти черепахи почти совсем истреблены. Бескрылая гагара (Alcа impennis), величиной с гуся, во множестве водилась на севере Атлантики и в южной части Ледовитого океана, особенно в Исландии; но после 1844 г. её уже нигде не встречают.
Уже в историческое время исчезли два подотряда бегающих птиц: новозеландский моа (род Dinornis), достигавший в высоту 3 ж и истреблённый маорийцами, колонизовавшими Новую Зеландию, и мадагаскарский страус (род Aepyornis), крупнейшие экземпляры которого достигали в высоту 5 м. Моа в Новой Зеландии существовал ещё 500 лет назад.
На Мадагаскаре и на о. Маврикия некогда жили дронты, или додо (Didus) — крупные птицы из группы голубиных. Европейцы ещё застали их, привозили в зверинцы Европы живьём, и с этих птиц были сделаны рисунки. Теперь дронтов нет.
Человек то препятствует расселению животных, то способствует. Прорытие Панамского канала затруднило процесс обмена фауной между Северной и Южной Америкой, так как для многих наземных животных (обезьян, ленивцев, муравьедов) канал является непреодолимой преградой. Зато, например, в Новую Зеландию человек случайно и нарочно завёз до 600 видов животных. В Новой Зеландии до появления европейцев не было травоядных млекопитающих, а теперь разведение их составляет одну из крупных отраслей хозяйства. Есть основание полагать, что динго, единственное хищное высшее млекопитающее Австралии — это одичавшая, завезённая сюда туземцами Австралии в прежнее время собака.
Во Франции, Англии и США в специальных садках искусственно разводят устриц. Человек вообще нередко изменяет фауну водоёмов, заселяя их теми животными, которых здесь не было. Так, в Каспий в 1931—1932 гг. было выпущено около 1 млн. мальков кефали, и рыба здесь прижилась хорошо.
Изменение фауны водоёмов происходит и помимо воли человека, хотя и в результате его деятельности, например в связи с постройкой гидротехнических сооружений. Если поперёк реки воздвигается большая плотина, то её влияние сказывается как выше зоны подпора, так и ниже — на приустьевом участке.
Выше плотины резко изменяется скорость течения, что влечёт за собой резкое изменение также в распределении и передвижении наносов: водохранилище выше плотины заносится минеральными и органическими веществами и приобретает черты озёрного режима; впрочем, раз в год, весной, во время половодья, вся водная масса водохранилища обновляется. Аккумуляция наносов вызывает ряд биохимических изменений. Типичные речные биоценозы уступают место озёрным. Если же аккумуляция очень интенсивна, как это бывает в горных реках, несущих много взвесей, то фауна вообще погибает; массовая гибель организмов — последствие придонного обеднения кислородом и накопления CO2 и H2S в результате гниения затопленной почвы и растительности; массовое развитие фитопланктона («цветение воды») тоже влияет на газовый режим.
Водохранилища, созданные человеком, быстро зарастают. Зарастание влечёт заболачивание, а последнее способствует развитию личинок малярийных комаров.
Гидротехнические сооружения оказывают также большое влияние на миграции рыб. Земоавчальская плотина на Куре преградила дорогу лососю (Salmo trutta labrax), который поднимался из Каспия для нереста в Арагви. Плотина Днепрогэса преградила ход осетровым и сельдям к местам нереста; плотина Волховстроя закрыла пути волховскому сигу, ходившему на нерест через Волхов и Ильмень в Ловать, Шелонь и Мету; на Нивагэсе плотина стала непреодолимым препятствием для сёмги.
Влияние плотины на участок реки, расположенный ниже по течению, сказывается в понижении горизонта реки, в уменьшении количества выносимых взвесей, особенно органических (так как они задерживаются и отлагаются выше плотины). Поскольку при уменьшении горизонта воды река часто перестаёт опреснять лиман, куда она втекает, характер фауны в этом лимане существенно изменяется.
Изменение и уничтожение человеком животных и растений приняло за последнее столетие такие размеры, что появилась необходимость специального законодательства и организации специальных учреждений для охраны природы. Возникли национальные парки и заповедники.
Широко поставлено дело заповедников в СССР. До Октябрьской революции их было всего два. В 1952 г. государственных заповедников было 40 с общей площадью около 1,5 млн. га.