От акуловых рыб с их открытыми жаберными щелями произошли, однако, по-разному, другие рыбы, развиваясь как бы по радиусам во все стороны.
Жаберные щели и дуги между ними стали прикрываться жаберными крышками, наползающими на них спереди назад. Щели спрятались под ними, что мы и видим у всех наших «костистых рыб» (сельдь, щука, карп и др.).
Со временем хрящевой скелет постепенно подвергался окостенению, замещался костной тканью. Это окостенение хряща повторяется и сейчас в процессе зародышевого и личиночного развития и на последующих молодых стадиях у всех высших животных вплоть до человека. У всех вначале развития возникает скелет из хряща, который постепенно вытесняется костью, не только в зародышевом состоянии, но и дальше, заканчиваясь уже в детском возрасте.
Итак, от акуловых возникли различные костные рыбы с их парными плавниками. У основания последних под кожей для опоры мышц образовались костные пластины, у грудных плавников — лопатка, а у брюшных — зачатки тазовых костей. Так появились грудной и брюшной пояса конечностей.
У некоторых рыб и сейчас все спинные, хвостовой и анальный плавники не разъединились, составляя непрерывающуюся складку-ленту (например, у угря). Но таких рыб, у которых и парные грудные плавники были бы связаны с брюшными по бокам тела, в наши дни нет.
Однако эту стадию проходит каждый зародыш акулы, да у некоторых ископаемых вымерших рыб вдоль тела по бокам сохранились скелетные лучи сплошного плавника.
У многих рыб стал по-разному образовываться плавательный пузырь (у акул его не было). Пузырь возникал из выпячивания стенки пищевода или кишечника. К стенкам пузыря подходят кровеносные сосуды о растворами газов. Газы эти из крови просачиваются через стенки в пузырь и помогают рыбам при плавании.
Многие тысячи лет рыбы были высшими животными на Земле. Не было тогда почти никого, кто был бы организован лучше их. Соперничать с ними могли разве только на первых порах, головоногие моллюски-спруты (осьминоги) и кальмары, огромные и быстро плавающие хищники (мало похожие на своих родственников улиток), дожившие и до наших дней. Но и они вскоре отстали в своем развитии от рыб и уступили им первенство. Заселив в океанах и морях толщу воды и прибрежную часть, густые заросли водорослей и дно моря, рыбы вошли в реки и проникли в озера. Претерпев здесь множество изменений, часть рыб вновь спустилась по рекам в моря и океаны. И всюду рыбы приспосабливались к разнообразным условиям жизни: камбала и скат стали плоскими и лежат на дне; морской конек цепляется хвостом за водоросли; у вьюна рот обращен вниз и окружен усиками, пищу он берет со дна. А у чехони рот обращен косо вверх, она берет пищу из-под поверхности воды. Такие разнообразные приспособления помогают рыбам в их соперничестве. Чем меньше они похожи между собой, тем легче им жить, добывать пищу. Но в древние времена разнообразие рыб было не столь велико и соперничество (конкуренция) понуждала их приспосабливаться как только можно к добыванию пищи и другим условиям.
Есть и в наши дни рыбы-прыгуны, выскакивающие из воды (в Индонезии и у берегов Африки), вылезающие из воды на берег, на корни береговых деревьев, где они охотятся за насекомыми. Не все рыбы хорошо приспособлены к такой жизни. Ведь тело в воде весит меньше, чем в воздухе. Чтобы двигаться на берегу, нужно затратить больше сил, да и не всякий плавник годится для такого способа передвижения. Выходить на сушу на длительный срок для охоты смогли только такие рыбы, грудные и брюшные плавники которых обладали у своего основания крепкими костями и мускулами. Скелетно-мышечная часть такого плавника далеко выдавалась наружу из тела (и могла поворачиваться), лишь на конце разветвляясь на лучи с перепонкой. А у обычных рыб лучи плавника начинаются почти сразу от самого его основания. Рыб таких называют кистеперыми. Большинство этих рыб вымерло, и нам известны лишь их скелеты да чешуя в ископаемом виде. Но один вид кистеперых дожил до наших дней. В передних (грудных) плавниках их проходит от лопатки вначале одна кость — плечевая, а дальше две рядом — локтевая и лучевая. Но в локте подвижность такого плавника еще недостаточная. И тем не менее расположение костей в плавнике уже похоже на скелетные части передней конечности.
Многим рыбам помогает при дыхании кишечник, если жабры не справляются с этой задачей. В водоемах, где достаточно гниющих растений, мало кислорода, рыбы (например, вьюн, шиповка) захватывают с поверхности воды ртом воздух и прогоняют его через кишечник. При этом стенки кишечника всасывают кислород и помогают таким образом дыханию. У других рыб не весь кишечник, а лишь плавательный пузырь помогает дыханию, причем, воздух в пузырь входит из кишечника через рот. Венозные сосуды, оплетающие стенку пузыря, отдают углекислый газ и кровь насыщается через те же стенки кислородом. Постепенно плавательный пузырь таких рыб становился легким. Оба органа у зародыша развиваются вначале одинаково и ясно, что легкие — это измененный плавательный пузырь. Когда водоемы пересыхают, некоторые рыбы зарываются в ил, ц, когда почти совсем не остается влаги, дышат все время «легкими», пока не кончится засуха. Такие рыбы живут в Южной Америке, Австралии и называются двоякодышащими.