Африканскую чуму лошадей следует отличать от сибирской язвы, пироплазмоза и трипанозомоза.
При указанных болезнях селезенка у павших лошадей значительно увеличена, в то время как при чуме она нормального размера. Кроме того, при лабораторном исследовании (микроскопии) в патологических материалах, взятых от лошадей, павших от сибирской язвы и кровепаразитарных болезней, можно обнаружить присутствие соответствующих возбудителей.