В зависимости от проявления аллелей в гетерозиготе различают доминантный и рецессивный аллели. Если гетерозигота проявляет признак как и одна из гомозигот, то это явление называется Доминирование, а соответствующий аллель — доминантным, обычно его обозначают заглавной буквой, например, А.
Другой аллель, который определяет признак только у гомозигот, называют Рецессивным и обозначают строчной буквой, например, А. В случае полного доминирования генотипы АА и Аа фенотипически не различаются, а проявление рецессивного аллеля можно наблюдать у гомозигот Аа. В тех случаях, когда гомозигота и гетерозигота фенотипически между собой различаются, то это называется Кодоминирование.