Еще меньше данных имеется об эпифизе как железе внутренней секреции.
Так, например, Романов пишет, что «иногда об эпифизе думают как об эндокринной железе. Однако никогда не было показано, что он имеет какую-либо секрецию и никто даже не высказал правдоподобного предположенин о его функции. По-видимому, это рудиментарный орган — гомологичный третьему глазу примитивных позвоночных». Бенуа же, наоборот, высказывает предположение, что эпифиз играет роль эндокринной железы. Только Бэлэчану с соавторами в своих опытах показал, что введение гормона эпифиза в инкубируемые куриные яйца вызывает задержку развития семенников, небольшое увеличение веса эмбрионов и сахара крови, а также увеличение количества билирубина почти в два раза.
Остановимся кратко на морфологии развития эпифиза. По данным Краббе, развитие эпифиза протекает сравнительно одинаково у эмбрионов разных видов птиц, однако у сов он совершенно рудиментарен и его дистальный конец напоминает париентальный глаз. Спиров наблюдал, что у куриного эмбриона первичный зачаток эпифиза появляется через 48 час. инкубации. Наиболее быстрый рост эпифиза происходит с 5-го до 12-го дня, когда его относительный объем возрастает в 40 с лишним раз; с 12-го дня до вылупления объем эпифиза почти не изменяется.