Возникновение марганцевого микроэлементоза связывают с низким содержанием марганца в почвах и в растениях (кормах). Дефицит марганца в корме — важная, но отнюдь не единственная причина заболевания.
В этнологии болезни определенную роль играет избыток в рационе йода и молибдена — антагонистов марганца. Заболевание протекает тяжелее при избытке в пище кальция и фосфора вследствие уменьшения всасывания марганца из тонкого отдела кишечника.