Изучение фенофондов лежит в основе феногеографии.
Феногеография — изучение географического распределения фенов и их комплексов в пределах всего ареала вида или его части. Значительная часть фенетических работ направлена на получение феногеографических данных.
Феногеографические методы позволяют сегодня решать одни из самых сложных задач в области изучения внутривидовой изменчивости — выделение популяций и групп популяций, определение попуЛЯЦИОННЬ1х границ. Другими важнейшими задачами феногеографии являются изучение действия естественного отбора, изоляции, миграций; выявление центров внутривидового многообразия и реконструкция истории становления популяций. Феногеография — источник важных данных для внутривидовой систематики, она дает материал для правильной организации ряда промысловых и биотехнических мероприятий.
Феногеография позволяет ставить и решать наиболее сложные проблемы фенетики, начиная от поиска популяционных границ и кончая восстановлением хода эволюции — изучением микрофилогенеза вида. Важное значение должна иметь феногеография для правильной организации биотехнических мероприятий, при решении целесообразно ли выделять какие-то группы популяций в качестве подвидов. Наконец, велико значение феногеографии для теории микроэволюции: изучения пусковых механизмов формообразования, пространственных тенденций в развитии внутривидовой изменчивости, формирования центров многообразия.