Фены могут быть выделены среди любых особенностей фенотипа: морфологических, физиологических, биохимических и других его свойств.
Вариации признаков гороха, выбранные Г. Менделем для анализа, вполне отвечают понятию «фен»: они дискретны, альтернативны, своим присутствием маркируют тот или иной генотип, а их частоты могут маркировать генетические особенности групп особей — линий, сортов и т. д.
У Drosophila melanogaster известно много сотен дискретных вариаций в строении тела, которые следует считать фенами. Так, много таких вариаций по форме и жилкованию крыла, окраске глаз и тела, расположению и особенностям строения щетинок, видоизменениям усиков, глаз, ножек, брюшных тергитов и т. д. Наряду с нормальным плоским крылом у дрозофилы встречаются особи с крыльями, изогнутыми в виде арки с вырезками на заднем крае крыльев, с зачаточными крыльями и без крыльев. Встречаются мухи с белыми глазами, с черным телом и т. д. Все эти вариации обусловлены мутантными аллелями. Все эти дискретные признаки могут служить признаками-маркерами генотипа являются фенами (или целыми группами фенов — фенокомплексами).
Феном физиологического признака является нечувствительность млекопитающих к сильнейшему яду — антикоагулянту варфарину.
Этот фен был обнаружен в 50-е гг. XIX в. после, казалось бы, успешного истребления крыс Rattus norvegicus в ряде стран Западной Европы в результате массового использования варфарина. Действительно, крысы в первое время практически исчезли в большинстве районов, где применяли варфарин. Но уже через несколько лет началось распространение «суперкрыс», обладающих признаком нечувствительности к варфарину. Оказалось, что кое-где в силу естественной генетической изменчивости в природных популяциях выжили единичные особи, нечувствительные к варфарину. Эта нечувствительность имела разную генетическую природу в разных популяциях и определялась действием, по крайней мере, трех генов.
Выше уже говорилось, что в последние годы большое внимание привлекает изучение изменчивости белков, выявляемой с помощью электрофореза. В двух соседних популяциях тропической ящерицы Anolis bimaculatus с Малых Антильских островов обнаружены одни и те же аллели, но частоты их встречаемости в популяциях существенно различаются; особенно отчетливы эти различия для локуса алкогольдегидрогеназы. В настоящее время на животных и растениях выполнены уже сотни аналогичных работ.
В поведении животных также можно выделить дискретные, генетически обусловленные вариации — фены этологических признаков. Одна из линий лабораторных мышей Mus musculus характеризуется появлением у животных аудиогенных (под влиянием сильного звука) судорог. При скрещивании мышей этой линии с особями дикого типа судороги отсутствовали у 99% потомков; «сильный» тип нервной системы оказался доминантным. Анализирующее скрещивание показало моногенное наследование данного признака. Несомненно, появление аудиогенных судорог можно рассматривать в данном случае как хороший поведенческий фен. Другим примером такого рода является гигиеническое поведение пчел; фенами здесь являются альтернативные признаки «удаляют — не удаляют больных личинок».
В приведенных простых примерах мы старались подчеркнуть, что фены отражают определенные черты генотипа особи.