Несовершенные грибы порядка Hyphomycetales рода Fusarium вызывают заболевание нескольких форм. Наиболее вредоносны корневая гниль и фузариозное увядание.
Гниль проявляется на верхней части главного корня или на боковых, где видны темно-бурые сухие или гниющие пятна. Сердцевина корня становится трухлявой, и растение погибает. Развитию корневой гнили способствуют плохие условия перезимовки клевера, особенно на 2-й год жизни.
Увядание растений происходит в результате закупорки сосудистых пучков корня и основания стебля. На поперечном разрезе видно побурение сосудов. Листья и побеги постепенно увядают, во влажную погоду у основания стеблей появляется белый пушистый налет спороношения. Семена формируются щуплые, серого цвета.
Возбудитель, развиваясь в почве на растительных остатках, а также в семенах, остается жизнеспособным 3—4 года. Поражаются ослабленные растения.
Сильнее страдают от фузариоза загущенные посевы бобовых трав под покровом яровых зерновых культур. Меньше поражаются зимостойкие сорта.