Успех хранения во многом зависит от газового состава кагатного воздуха, в частности соотношения углекислого газа и кислорода.
Наиболее благоприятные условия для хранения маточных корнеплодов создаются, если в кагатном воздухе кислорода содержится 12—14 %, углекислого газа — около 5 %. При хранении маточных корнеплодов свеклы в условиях повышенной концентрации углекислого газа не только наблюдаются потери массы и сахара (в связи с более интенсивным дыханием), и тем больше, чем больше в хранилище углекислоты, но и снижается семенная их продуктивность. В опытах Н. И. Корженко (ВНИС) при хранении маточных корнеплодов в течение месяца в хранилище, где концентрация углекислого газа составляла около 60 %, они потеряли способность к прорастанию. Гибель центральной почки наблюдалась у 16,3 % при хранении в течение 20 дней и у 30 % при храпении 30 дней без доступа воздуха в хранилище. Средний урожай семян с одного растения был 90 и 75 г, а при хранении без доступа воздуха в течение 10 дней — 123 г. При отсутствии аэрации, что может быть в кагатах со свеклой, накопление углекислого газа быстро возрастает. Имеет значение и температура в хранилище. Если она в пределах 0°, 2°С, то углекислый газ накапливается постепенно и соответственно уменьшается содержание кислорода в хранилищах. Если температура 8 ° С и выше, то количество углекислого газа уже на пятый день может быть 25 —30 %, если нет доступа воздуха в хранилище. Отсюда следует практический вывод, что длительное хранение маточных корнеплодов в кагатах, где нарушена аэрация, неизбежно приводит и к потерям хранимых корнеплодов, и к снижению их семенной продуктивности.
Газовый состав воздуха в хранилище может изменяться и в зависимости от степени загрязненности свеклы. Приставшая грязь закупоривает поверхность корнеплодов и промежутки между ними, что затрудняет аэрацию, повышает температуру, в результате повышается активность микроорганизмов и интенсивность дыхания.
Для нормального хранения свеклы вредно избыточное количество не только углекислоты, но и кислорода. Снижение уровня кислорода в среде повышает холодостойкость, обогащение среды углекислым газом ослабляет дыхание свеклы, а обогащение кислородом стимулирует дыхание. Хорошее хранение свеклы требует умеренного дыхания. Значительное количество углекислоты, образуемое в ходе дыхания, удерживается корнеплодами, а если дать свежий воздух, то углекислота сразу же освобождается. Надо учитывать, что главный возбудитель кагатной гнили — грибок Ботритис синереа — аэроб, поэтому приток кислорода может стимулировать его развитие.
Меры предупреждения нарушения нормального газового состава воздуха в хранилище: соблюдать рекомендации по глубине траншей и высоте укрытия кагатов; не допускать повышенного увлажнения почвы и сильного загрязнения свеклы, не выделять под кагатное поле участки с блюдцами, с высоким уровнем грунтовых вод, на сильно заплывающих почвах; весной не задерживать выемку корнеплодов после снятия земляного укрытия.