В геологическом строении западной и восточной частей суши, окружающей Индийский океан, имеются существенные различия.
Западная часть Индийского океана ограничена берегами Африки. В прибрежной полосе восточной Африки на погруженном древнем фундаменте выделяется ряд впадин. В южной части материка это впадина Карру с заполняющими ее отложениями верхнего палеозоя — триаса, севернее, в Мозамбикском проливе, впадину заполняют мезозойские и кайнозойские отложения. Распространение впадины Карру на север прерывается выступом древнего кристаллического фундамента в северной части Мозамбикского пролива. Но и здесь в прибрежной полосе на погруженном фундаменте имеются мезозойские и кайнозойские отложения. Такие отложения распространены также в области Сомали — на широком пространстве склона древней платформы.
Следовательно, прибрежную область восточной Африки можно рассматривать как сочетание в разной мере опущенных частей склона древней платформы материка и отдельных его впадин, выходящих к океану. Опускания эти, происходившие в мезозое, продолжались и в неогене. В прибрежной западной части Мадагаскара наблюдается зональное геологическое строение. Возраст отложений по мере удаления от берега возрастает. Строение такого типа могло сформироваться в условиях длительного опускания прибрежной части острова. Судя по возрасту отложений, прибрежная полоса опускалась в течение мезозоя и кайнозоя.
Дикси считает, что Мозамбикский пролив, восточная часть Африки и о. Мадагаскар входили в состав Мозамбикской геосинклинали, для которой было характерно длительное, прерывисто развивавшееся погружение. Образование системы Восточно-Африканского рифта Дикси ставит в зависимость от движений в области Мозамбикской геосинклинали с ее сложной системой дробления и погружения. Рифтовые разломы считаются названным автором составной частью длительно развивавшейся (во всяком случае в течение мезозоя и кайнозоя) Мозамбикской геосинклинали.
В значительной мере сходными чертами обладает и Аравийское море. Прибрежные части Аравийского полуострова представляют опущенные краевые части древней платформы, перекрытые отложениями мезозоя и кайнозоя, которые прорваны молодыми вулканическими излияниями. Северная часть Аравийского моря представляет область молодых погружений, захвативших окраинную часть альпийских структур прилегающей части Ирана. Все рассматриваемое прибрежное пространство от Южной Африки до северной части Аравийского моря представляет области недавних (большей частью начиная с мезозоя и продолжающихся до четвертичного времени) опусканий раздробленных прибрежных структур.
По западному берегу п-ов Индостан ограничен рядом молодых разломов, возраст которых Кришнан считает плиоценовым. Более сложна история развития, а в связи с ней и геологическое строение восточного побережья Индостана. Здесь платформенный фундамент в течение мезозоя неоднократно погружался и его опустившаяся поверхность служила дном мезозойского моря, а современные очертания берегов связаны с молодыми (плиоцено-четвертичного времени) разрывными нарушениями и опусканиями.
Большой сложностью геологического строения отличается северо-восточная часть Индийского океана, ограниченная островными дугами Индонезийского архипелага. Главная особенность структуры рассматриваемой области заключается в сочетании абиссального Яванского желоба с резко контрастными ему по высоте островными дугами. В Андаманском море отчетливо выражено раздробление складчатого пояса с недавним (плиоцено-четверичным) опусканием отдельных его частей. Если в рассмотренных выше частях побережий Индийского океана тектоническое раздробление произошло на заключительном этапе неоднократных вертикальных движений, то в северо-восточной части этого океана раздроблению подверглись уже альпийские структуры, разорванные и неравно мерно опущенные ниже уровня океана.
По прибрежной полосе на западе Австралии отмстим опускание плат формы (краевого прогиба), где континентальные осадки среднего палеозоя покрыты морскими мезозойскими и кайнозойскими отложениями. Полнота и возрастающая мощность палеозойских отложений по направлению к океану дали основание Тайхерту выделять Западно-Австралийскую геосинклиналь. Заметим, однако, что полнота разреза и возрастающая мощпость возможны не только в геосинклинальных условиях, но и в краевом прогибе платформы. В обзоре геологического строения побережий Индийского океана остается еще отметить, что на крайнем юге его ограничивает побережье восточной Антарктиды, представляющее в структурном отношении древнюю платформу, осложненную многочисленными разломами, по которым в кайнозойское время изливались базальты.
Из островов Индийского океана самым крупным является Мадагаскар. О геологических условиях его западной части было сказано выше. Восточная часть острова образована выступом древнего кристаллического фундамента и, возможно, представляет часть древней гондвайской платформы. В последующем, когда образовались разломы, они имели большое значение в формировании берегов и внутренних частей острова. С этими же линиями разломов связано излияние базальтов, образовавших Коморские острова. Сейшельские острова находятся на подводном хребте, протянувшемся на юг до Маскаренского архипелага. На Сейшельских коралловых островах известны также выходы гранитов, что, возможно, указывает на продолжение в эту часть океанического дна структур древней гондванской платформы. На Маскаренских островах известны вулканические породы — базальты и молодые лавы основного состава, близкие к излившимся на Гавайских островах. Острова Кергелен и Бирд в южной части океана образовались из базальтов кайнозойского возраста. Считается возможным, что здесь вулканическая деятельность продолжалась и в течение четвертичного периода. Острова Ликкадивские и Мальдивские, расположенные на Срединном хребте Индийского океана, имеют коралловую природу. Острова Амстердам и Сен-Поль, находящиеся на крайнем юге Срединного Индийского хребта, сложены базальтами.