К этому типу относятся моря Индонезии. Наиболее важными чертами рельефа дна морей такого типа являются большая его контрастность, расположение высоких островных гряд поблизости от глубоких и круто-склонных впадин.
Морфологическая сложность еще более возрастает за счет вулканических форм подводного рельефа. Создается впечатление, что еще недавние тектонические процессы здесь протекали особенно напряженно, не прекращаясь и в современную эпоху.
К трансгрессионным подводным равнинам с унаследованным рельефом относятся пространства дна Яванского моря и южной части Южно-Китайского. Здесь в начале четвертичного периода располагалась суша, расчлененная сложной сетью речных долин.
Вдоль южной окраины архипелага располагается пояс краевых впадин неотектонического погружения. В него входят впадины моря Флорес, моря Саву, впадина Вебера. Кюнен относил названные впадины к типу бассейнов с плоским дном. Положение впадин между двумя грядами островных поднятий указывает на возможную их принадлежность к типу межгорных прогибов (еще не компенсированных накоплением осадков). К этому же типу следует отнести впадину между островами Тимор и Ветар. Все впадины данного типа отделены друг от друга подводными порогами. Наиболее крутые склоны впадин (до 20° и более) известны в их верхней части. С глубиной они постепенно выполаживаются. Отмеченный характер профиля склона может указывать на сбросовое происхождение впадин; их можно связывать с полосой краевых разломов и вертикальных перемещений по ним.
Наибольшую площадь акватории в архипелаге Индонезии занимают межостровные впадины. По морфологическим признакам среди межостровных впадин можно различать три типа.
Впадины с крутыми склонами и плоским дном в виде аккумулятивной равнины (впадина Целебесского моря, моря Сулу, южная часть впадины Банду). Образование их Кюнен ставит в связь с опусканием континентальных структур по сбросам. Первоначальный рельеф дна сглажен осадконакоплением.
Впадины с крутыми склонами и сложно расчлененным дном. К ним относятся большая часть впадины Банду и отчасти в море Сулу. Они чередуются с далеко протянувшимися подводными возвышенностями и достигают глубины 5000 м. Наиболее вероятно, что впадины этого типа образовались путем погружения складчатых структур, сохранивших первоначальные формы тектонического расчленения.
Межостровные прогибы, отличающиеся линейно вытянутыми контурами с чередованием ложбин и поднятий между ними. Примером служит депрессия Сангир, продолжающаяся на юге в Молуккское море. К данному типу относится и Церамское море. Наиболее простое из образований этого типа — депрессия Макассарского пролива. Все названные межостровные прогибы совпадают с поясами неотектонических опусканий, намеченных среди островов Индонезии Е. Н. Люстихом. Сходного типа структурные образования известны в районе Филиппинских островов, где они, по мнению Ирвинга, имеют постплиоценовый возраст. Вероятно, такого же возраста и прогибы среди островов Индонезии.
Сложно расчлененпый подводный рельеф Индонезийского архипелага отвечает молодости и контрастности неотектонических и современных движений в его отдельных частях. В сравнении с другими геосинклинальными морями вертикальные перемещения земной коры здесь достигли особенно больших размеров.