У этой группы грибов много разных названий, но ни одно из них пока не является безупречным. Группа отличается полифилетичностью.
Далее рассмотрены некоторые варианты положения анаморфных грибов в царстве Fungi.
1. Раньше эта группа рассматривалась в ранге отдела; такое положение условно принималось микологами, которые отмечали формальность таксона, имеющего полифилетическое происхождение. Согласно современной систематике таксон должен иметь монофилетическое происхождение.
2. В системах последних лет многие виды, для которых установлено наличие телеоморфы, рассматриваются в соответствующих отделах (при этом в самостоятельную группу анаморфные грибы не выделяются). Это вполне объяснимо, так как анаморфы, например ржавчинных грибов, рассматриваются в отделе Basidiomycota. В том случае, если телеоморфа не обнаружена, родство устанавливается на основе молекулярно-генетических исследований.
3. Одним из вариантов, которого мы придерживаемся, является объединение анаморфных грибов в группу, куда включены анаморфы грибов, относящихся к Ascomycota и Basidomycota. В группу входят: 1) анаморфные виды, у которых утрачена телеоморфа, поэтому они имеют одно название; 2) анаморфные виды, которые иногда образуют телеоморфу, поэтому у них есть два названия и, следовательно, два места «регистрации». Например, сфацелия (анаморфные грибы) является анаморфой спорыньи пурпурной (отдел Ascomycota). Внутри группы грибы подразделены на более мелкие группировки, которые для удобства рассматриваются в ранге формальных классов, семейств и родов:
класс гифомицеты (Hyphomycetes);
класс целомицеты (Coelomycetes);
класс бластомицеты (Blastomycetes).