III этап органогенеза проходит в период естественного или вынужденного покоя. У репчатого лука и чеснока органообразовательные процессы проходят в луковице еще в хранилище, у многолетних видов лука и порея — в поле осенью. В этот период дифференцируются конус нарастания и соцветие.
IV этап характеризуется формированием цветочных бугорков, V — органов цветка — тычинок и пестиков.
VI этап и последующие проходят у луков на 2-й год жизни в период вегетации. В это время формируется микро — и макроспорогенез; растут и развиваются стрелки и цветки; окончательно формируются соцветия и бутоны, разрывается обертка, начинается цветение 1-го яруса цветков (VII и VIII этапы). IX и X этапы — оплодотворение и образование зиготы на цветках 1-го яруса; цветение цветков 2-го яруса и их оплодотворение и т. д., рост и формирование коробочек и семян, в зародыше идет процесс дифференциации органов.
XI этап — налив семян и накопление в них питательных веществ и заканчивается XII этапом, когда питательные вещества семян превращаются в запасные.
Требования растений к условиям среды в период прохождения ими отдельных этапов жизненного цикла должны быть положены в основу при разработке агротехнических приемов, направленных на получение высокого урожая.
На 2-м году жизни после отрастания листьев начинается формирование цветочной стрелки, которая дифференцировалась в течение осенне-зимнего или зимне-весеннего периода в луковице. Для некоторых сортов репчатого лука при выращивании из рассады и значительно реже при посеве семян непосредственно в грунт, особенно в северной зоне, в 1-й год жизни у 1—7% растений появляются стрелки. Характерно, что сорта порея типа Болгарский в Ленинградской области на 70—100% образуют стрелку., на юге не стрелкуются. Это явление можно объяснить только длиной дня. В северных широтах его продолжительность в июне—июле в среднем составляет около 18 ч, поэтому группа сортов успевает в 1-й год пройти все стадии развития.