Свиньи являются носителями бактерий, вирусов, грибов, глистов и, возможно, прионов.
Из хорошо изученных заболеваний человека, которые он может получить от свиней, можно отметить бруцеллез, лептоспироз, листериоз, кампилобактериоз, лошадиный энцефалит, грипп, герпес, токсоплазмоз, аскариоз и ряд других (D. К. С. Cooper et al., 1991).
Только за последние 10-15 лет у свиней обнаружили 3-4 штамма вируса герпеса, представляющего опасность для здоровья человека. Считается, что выращивание свиней даже в условиях полной стерильности не гарантирует вирусную чистоту животных, поскольку никак не проявляющие своего присутствия вирусы могут быть локализованы в хромосомах и генах свиней. Например, в 1997 г. британские вирусологи выделили из организма свиньи эндогенный ретровирус PERV-PK, который легко инфицирует клетки человека в пробирке. Этот вирус присутствует в сердце, селезенке и почках свиней. В каждой клетке свиньи ученые обнаружили около 50 копий вирусной ДНК. Избавить клетки от нее пока не представляется возможным.
В 1998 г. американские ученые выделили из тканей миниатюрных свиней эндогенный ретровирус PERV MSL, который локализуется в генах белых кровяных клеток. Однако обследование 150 человек — реципиентов свиных органов (ткань поджелудочной железы, стволовые клетки эмбрионов свиньи, очищение крови больных посредством перфузии свиной печени) — не выявило в организме больных свиных вирусов или антигенов к ним.