Несмотря на то, что род Raphanus небольшой, у ботаников нет единства в определении его объема.
Внутривидовое разнообразие культурной редьки — R. sativus L. — давно привлекало внимание многих систематиков. В «Исследованиях о растениях» (1951) Феофраст (372—287 гг. до н. э.) дал первое описание разнообразия корнеплодной редьки, возделываемой в Древней Греции. Отмечено, что у коринфской редьки часть корнеплода приподнята над поверхностью почвы, у беотийской — самые крупные и сладкие корнеплоды, у клеонейской — корнеплоды длинные, у леофасийской (фракийской) — листья гладкие. По свидетельству Плиния Старшего, во времена Римской империи в Европе выращивали редьку, корнеплоды которой достигали размеров детской головы. В средневековых «Травниках» имеются рисунки редьки и описания разных форм. Однако в названиях была большая путаница, часто под одним латинским названием «rapa» подразумевались разные культуры (редька, свекла, репа). Нередко к ним присоединяли хрен. Не было единства в названиях редьки: белую именовали R. sylvestris, R. vulgaris, R. magnus (P. Mathiolus, 1571; K. Gesner, 1561; M. Lobelius, 1576), черную — R. cortice nigricante, R. byzantinus, R. niger (P. Mathiolus, 1571; J. Daleschamp, 1587; C. Bauhin, 1623).
Карл Линней (С. Linnaeus, 1753) неоднократно обращался к изучению формового разнообразия редьки европейской. В 1737 г. он установил пять разновидностей: a-R. minor (редис), b-R. oblongus (редька продолговатая), c-R. orbicularis (редька круглая), d-R. albiflorus (редька белоцветковая), e-R. niger (редька черная). В 1748 г. Линней сократил их до трех: редис, редька круглая летняя (Sommerratica) и редька черная зимняя (Vinterratica). В 1753 г. в «Species Plantarum» установил только две разновидности: sativus (объединил редис с редькой летней) и niger. В 1763 г. он добавил еще одну разновидность: chinensis annuus oleiferus (китайская масличная).
Ph. Miller (1768) расчленил линнеевский вид R. sativus L. на четыре самостоятельных вида: R. rotundus Mill, (редис), R. orbiculatus Mill, (редька белая), R. niger Mill, (редька черная), R. chinensis oleiferus Mill, (редька масличная). J. Kerner (1788) в пределах R. sativus L. признавал только две формы: niger — редька и minor — редис.
Линней описал всего два вида редьки — R. sativus (культурная) и R. raphanistrum (дикая). Его сын добавил описание индийской культурной «стручковой» редьки R. caudatus L. f. Позднее были открыты новые дикие редьки: R. maritimus Smith, R. landra Мог. ex DC., R. rostratus DC. и R. microcarpus Lange. В 1919 r. A. Thellung объединил все эти виды, включая R. sativus, в один — R. raphanistrum L., и рассматривал их в качестве подвидов и разновидностей последнего. Возделываемую редьку R. sativus L. он предложил считать гибридом R. maritimus X R. rostratus. Этим он хотел показать, насколько мало различаются между собою виды редьки.
P. De Candolle (1821, 1824), приводя описания разных видов редьки, делит род по признакам плода на две секции: Raphanis и Raphanistrum. В первой секции он рассматривал виды R. sativus L. и R. caudatus L. f., а во второй — R. rostratus DC., R. raphanistrum L., R. landra Мог. ex DC. и R. maritimus Smith. Линеевский вид R. sativus он пересмотрел и расчленил на два вида: R. radicula (Pers.) DC. — редис (с формами f. rotunda, f. oblonga, f. oleifera) и R. niger (L.) DC. — редька (с формами f. vulgaris, f. rotundus, f. albus). Кроме того, он отметил, что редька распространена в Китае, Японии и Западной Азии. Позднее L. Reichenbach (1831—1832) и J. Metzger (1841) описали множество европейских форм R. sativus L., различая их по морфологическим и биологическим признакам (масса, форма, окраска корнеплода, жизненный цикл).
F. Alefeld (1866) впервые объединил все разнообразие форм в три группы разновидностей, выделив их по окраске корнеплода. Стручковидные формы им отнесены к группе разновидностей редьки масличной.
О. Е. Schulz (1919) высказал мнение, что близки между собой только R. raphanistrum, R. rostratus и R. microcarpus, объединив их под названием R. raphanistrum, L., a R. maritimus соединил с R. landra. Стручковидную редьку — R. caudatus — он считал гибридом R. raphanistrumXR. sativus, а возделываемую редьку корнеплодную — R. sativus — подразделил на две расы: proles radicula (Pers.) О. Е. Schulz и proles niger (Pers.) О. E. Schulz.
E. H. Синская (1928) перевела расы (proles), выделенные О. Е. Schulz (1919), в подвиды: subsp. radicula (Pers.) Sinsk. — однолетние формы (редисы) и subsp. hybernus (Alef.) Sinsk. — двулетние (редьки). По признаку окраски корнеплода (как более устойчивому) выделила 12 разновидностей: у редьки — var. albus DC. — корнеплоды белые, var. niger Sinsk. — черные, var. griseus DC. — серые, var. rubrus Sinsk. — красные или розовые, var. violaceus Sinsk. — фиолетовые; у редиса — var. subalbus Sinsk. — белые, var. subniger Sinsk. — черные, var. subgriseus Sinsk. — серые, var. chloris Alef. — желтые, var. subviolaceus Sinsk. — фиолетовые, var. rubescens Sinsk. — красные или розовые, var. striatus Sinsk. — пестрые (белые с красными полосами). По форме и окраске корнеплодов она привела описания 56 типов редисов и редек. Впоследствии Е. Н. Синская (1931) выделила в самостоятельный вид R. indicus Sinsk., объединив в нем длинностручковые формы индийского редиса (Radis de Madras).
J. Helm (1957, 1959) отнес все разнообразие культурных редек и редисов к одному виду R. sativus L. и подразделил его на пять разновидностей: var. gayanus (Web.) Helm — редька одичавшая, var. oleiformis (Pers.) Helm — редька масличная с формами: f. chinensis (Mill.) Thell. и f. longirostrus Thell.; var. mougri Helm — редис длинностручковый (индийский и яванский); var. sativus — редис и var. niger L. — редька.
О своеобразии японских редек впервые очень кратко упомянул De la Blanchere (1876) и, ссылаясь на него, О. Е. Schulz (1919) присоединил их к линнеевскому виду R. sativus. Японские ученые Т. Makino и К. Nemoto (1931) называют эту эндемичную редьку R. sativus var. macropodus, а И. Нисияма (1958) — R. sativus var. hortensis Baker. В качестве отдельного вида ее принимал, кроме De la Blanchere (R. acanthiformis), еще H. Leveille (R. macropodus). По тихоокеанскому побережью Японии растет дикая редька, внешне резко отличающаяся от культурной. Японские ботаники присоединяют ее также к линнеевскому виду R. sativus в качестве формы — f. raphanistroides (Т. Makino, 1909) и называют ее «Hama-daikon» (дикая редька). Е. Н. Синская (1930, 1931) пришла к заключению, что японские редьки (дикие и культурные) следует считать другим особым видом — R. raphanistroides (Makino) Sinsk., а не R. sativus L.