При исследовании возможности использования аминокислот в качестве источников углеродного и азотного питания в состав среды вводят исследуемую аминокислоту, затем определяют ее количественное содержание по ходу культивирования.
Параллельно проводят наблюдение за ростом культуры. При использовании комплексных сред, содержащих в своем составе сложные органические вещества (кукурузный экстракт, соевую муку и т. д.), часть аминокислот находится в свободном состоянии, часть в связанном, в основном в белковых молекулах. В этом случае очень трудно установить, какие из присутствующих в среде аминокислот наиболее интенсивно включаются в метаболизм. Основная трудность заключается в том, что белок среды в течение некоторого времени остается не полностью гидролизованным протеазами продуцента. Поэтому аминокислоты постепенно освобождаются при гидролизе белка. Для оценки интенсивности включения аминокислот в обмен веществ создают синтетические среды, состоящие из чистых аминокислот. Анализ содержания аминокислот в таких средах показывает, что с наибольшей интенсивностью в метаболизм некоторых актиномицетов включаются глютаминовая и аспарагиновая кислоты, α-аланин и гистидин. Такие аминокислоты, как лизин, триптофан, метионин, фенилаланин, слабо включаются в обмен веществ актиномицетов. Их количество на протяжении всего времени культивирования остается примерно на одном уровне. Однако это не исключает необходимости их присутствия в средах для биосинтеза антибиотиков. Лизин, например, оказывает положительное влияние на биосинтез стрептомицина. Метионин является источником метальных групп при биосинтезе эритромицина, а также некоторых других антибиотиков, имеющих в составе своей молекулы метальные группы.