Большинство из сотен описанных у кукурузы различных генетических факторов по своей природе являются качественными.
Качественные признаки относительно легко распознаются, так как при их расщеплении образуются хорошо различимые классы. Такие признаки обычно определяются одиночными генами.
Отвечающие за различные признаки гены кукурузы разделяются на 10 групп сцепления, соответствующие десяти разным хромосомам. Хромосомы пронумерованы от единицы до десяти в порядке убывания их длины.
Приведена карта сцепления десяти хромосом кукурузы. Эта карта дает приблизительную локализацию генов. Описание даваемых ею признаков приведено Эмерсоном, Бидлом и Фрейзером, и Нейффером, Джонсом и Зубером.
Методы определения локализации генов включают использование тестеров сцепления, трисомиков, транслокаций, инверсий и т. п.