Существенный раздел защиты растений представляют мероприятия, направленные на предотвращение завоза на территорию нашей страны иноземных вредителей, болезней и сорняков (внешний карантин), а также своевременное выявление, локализация и ликвидация очагов карантинных объектов, проникших в страну (внутренний карантин).
Карантинные мероприятия осуществляются Государственной службой по карантину растений МСХ СССР по специальным инструкциям.
Наиболее важными объектами внешнего карантина из числа болезней в настоящее время являются: желтый слизистый бактериоз и индийская головня пшеницы, бактериальное увядание кукурузы, антракноз хлопчатника, техасская корневая гниль, рак цитрусовых, ожог плодовых деревьев и др. Объектами внутреннего карантина являются: диплодиоз кукурузы, рак картофеля, мальсекко цитрусовых, оспа (шарка) слив и др.