Основное значение имеют агротехнические мероприятия (обработка почвы, сроки посева, уборки и др.), выращивание устойчивых сортов и уничтожение промежуточных хозяев.
1. Уничтожение источников ржавчины — зараженной стерни, падалицы (самосева; пшеницы и сорняков, на зараженной стерне зимуют телейтоспоры стеблевой, корончатой, частично карликовой ржавчины, которые служат источником весеннего возобновления этих видов ржавчины. На падалице пшеницы возможно развитие многих видов ржавчины (бурая пшеницы, желтая и стеблевая пшеницы и ячменя) в период от уборки урожая до всходов озимых, Поэтому падалица представляет опасность для озимых культур как своего рода промежуточник.
Дикие злаки — пырей, ежа сборная, эгилопс и другие сорняки — могут иметь значение в накоплении инфекции и ее зимовке для таких видов, как, например, линейная ржи, корончатая овса, бурая и желтая ржавчины пшеницы.
Для уничтожения падалицы, стерни и сорняков должно проводиться раннее лущение с последующей глубокой зяблевой вспашкой.
2. Пространственная изоляция посевов яровой и озимой пшеницы, так как зараженные озимые посевы служат обычно очагом ржавчины, откуда она распространяемся и на яровые посевы,
3. Предпосевная обработка семян микроэлементами (медь, марганец, цинк, бор, кобальт, молибден и др.). Микроэлементы берут в концентрации от 0,1 до 0,001 % (для разных микроэлементов). На 1 ц семян расходуют 8—10 л раствора. Семена намачивают в течение 6—12 ч, после этого высевают. Лучше обрабатывать семена микроэлементами сухим способом, добавляя последние к протравителям. Такая обработка семян повышает устойчивость растений, снижает вредоносность ржавчины и других болезней.
4. Рациональные сроки посева. Для яровых культур рекомендуют оптимально ранние сроки, так как в этом случае растения проходят ранние фазы развития в условиях, неблагоприятных для ржавчины; поздние посевы яровых сильнее поражаются ржавчиной.
Посев озимых (пшеница, ячмень, рожь) следует производить в сжатые, оптимальные для данного района сроки.
5. Внесение под посевы зерновых полного минерального удобрения с повышенными дозами фосфора и калия. Это снижает зараженность посевов ржавчиной. При внесении же больших доз азотного удобрения (одного или совместно с калием и фосфором) стеблевая ржавчина, например, развивается очень сильно. Дополнительная подкормка озимых посевов осенью и весной фосфорно-калийными удобрениями, сопровождающаяся рыхлением междурядий, положительно сказывается па оздоровлении посевов.
6. Ранние сжатые сроки уборки имеют большое значение в борьбе с ржавчиной, так как это мероприятие уменьшает вредоносность ржавчины (сокращает действие ее на растение) и предупреждает появление падалицы. Рекомендуют проводить раздельную уборку, не допуская перестоя пшеницы на корню и осыпания зерна.
7. Посев ржавчиноустойчивых сортов. Это мероприятие является наиболее эффективным в борьбе с ржавчиной зерновых злаков. В настоящее время значительные площади заняты посевами устойчивых сортов. Из районированных сортов пшеницы повышенной устойчивостью характеризуются сорта твердой пшеницы (Мелянопус 69 и др.), а из мягких — Безостая 1 (этот сорт поражается ржавчиной — расой 100), Белоцерковская 198, Дальневосточная. Из сортов овса высокой устойчивостью к корончатой и стеблевой ржавчине обладает сорт Советский.
Учитывая возможность появления более агрессивных рас возбудителей ржавчины и потерю устойчивости сортом, следует практиковать периодически смену сортов. Совершенно не допускается совместное выращивание устойчивых и неустойчивых сортов. При организации периодической смены сортов необходимо повышать и общий уровень агротехники.
8. Уничтожение промежуточных хозяев является одним из главных мероприятий в борьбе со стеблевой, корончатой и отчасти с карликовой ржавчиной. Кустарники (барбарис и разные виды крушины) выкорчевывают или уничтожают, применяя поваренную соль (2—8 кг под растение в зависимости от величины куста; при вырубке кустов корни засыпают солью — 1—4 кг на куст) или гербициды. Гербициды применяются в ранневесенний период, когда начинается сокодвижение. Из гербицидов используют сульфат аммония (100—200 кг на 1 га).