Поражаются проростки и всходы, реже растения в фазе 3—4 листьев. Проростки буреют, а при сильном поражении покрываются глубокими язвами и отмирают. Всходы заражаются, начиная с фазы семядолей. На пораженных растениях корневая шейка буреет, на ней могут образовываться и язвы, стебли размочаливаются; корневая система слабо развита, а в случае поражения растения в фазе семядолей разрушается.
Пораженные всходы отмирают, растения же более позднего возраста в большинстве случаев выживают, но отстают в росте.
Корневая гниль вызывается различными почвенными микро-организмами, из которых особенно большую опасность представляет почвообитающий гриб Rhizoctonia adcrholdii (Ruhl.) Kolosch. Этот гриб поражает многие сельскохозяйственные и дикорастущие растения. В цикле развития паразита имеются мицелий и склероции, долго сохраняющиеся в почве, а также базидиальное спороношение типа Hypochnus. Из почвы мицелий проникает в растение, причем в первую очередь заражает корневую шейку, а затем и корни.
Корневая гниль поражает главным образом слабо развитые, поврежденные всходы. Массовому поражению посевов способствуют холодная влажная погода в период всходов, плохая обработка почвы, несвоевременное прореживание, а также низкое качество семян.
Наряду с ризоктониозной корневой гнилью существует второй тип корневой гнили, поражающий растения, как в фазе всходов, так и во взрослом состоянии. Причиняет его также почвообитающий и тоже многоядный гриб Thielaviopsis basicola Ferr. из класса несовершенных. Пораженные всходы имеют тусклый сероватый или антоциановый цвет. Корни становятся сначала темно-пурпурными, а впоследствии черными, в связи, с чем этот тип гнили носит название черной корневой гнили. При сильном поражении кора мацерируется. Взрослые растения поражаются под осень, они внезапно увядают, листья при этом светлеют, поникают, но не опадают, у корневой шейки наблюдается вздутие.
Па концах гиф возбудителя образуются темные хламидоспоры, состоящие из 2—6 тесно сросшихся цепочкой клеток. Наряду с этим гриб образует в изобилии бесцветные палочковидные более мелкие эндоконидии, образующиеся цепочкой внутри нитевидных конидпеносцев.
Данный тип гнили в более сильной степени поражает взрослые растения тонковолокнистого и в меньшей степени средневолокнистого советского хлопчатника.
Источниками инфекции обоих типов гнилей являются почва и остатки зараженных растений.
Корневая гниль широко распространена во всех хлопковых районах и является основной причиной изреживания всходов.
Меры борьбы
1. Хорошая предпосевная обработка почвы.
2. Использование на посев высококачественных семян, протравленных трихлорфенолятом меди (см. гоммоз) или опудренных сернокислым аммонием (5 кг на 1 ц семян).
3. Своевременное и тщательное рыхление корки, своевременное прореживание всходов.
4. В районах поливного хлопководства должна быть правильная планировка полей, не допускающая застоя воды на отдельных участках.
5. Соблюдение севооборота.
6. Удаление гуза-паи с корнями.