По внешнему виду корни сосны похожи на корни ели.
Тонкие корешки сосны — без волосков, корневые мочки — темно-коричневого цвета, отходят веерообразно. Скелетные корни сосны, в отличие от корней ели, — светлокоричневого цвета, шелушащиеся чешуйки покровной ткани в 2—3 раза длиннее, чем у ели. Последний признак является характерным отличием сосновых корней от еловых.
Главный корень сосны имеет форму редьки длиной 60— 70 см. От него во все стороны отходят горизонтальные корни, а продолжением его являются 2—3 более тонких стержневых корня, которые проникают в почвогрунт почти вертикально. В тех случаях, когда стержневые корни достигают уплотненных горизонтов, они резко сокращаются в размерах и сходят на нет.
Корневая система сосны по сравнению с елью распределяется по генетическим горизонтам более равномерно.
В верхнем горизонте A1 сосредоточено 63,5% сосновых корней, т. е. на 20% меньше, чем в еловых культурах. В горизонте А2 содержится 26% сосновых корней, — это почти в два раза более, чем в еловых культурах. Таким образом, в чистых культурах сосны в двух верхних горизонтах (от 0 до 30 см) содержится 89,5% общей массы всех корней, в то время как в чистых культурах ели только в первом верхнем (от 0 до 9 см) горизонте содержится примерно такое же количество (83,5%). Следовательно, для сосны характерно более глубокое залегание корневой системы. Она полнее использует глубокие горизонты почвы. Ее корни проникают в почвогрунт на 190 см.
В глубинные уплотненные горизонты корни сосны в большинстве случаев проникают также по трубкам истлевших корней осины или березы. Старые корни, имеющиеся в почве, создают благоприятные условия для развития корневой системы сосны.
Сеть мелких корней у сосны развита слабее, чем у ели; вес их от общей корневой массы составляет 12,4%.
Эти биологические особенности корней сосны и ели необходимо учитывать при смешении данных пород в культурах.