Крупносемянность кедровых орехов не зависит от размеров дерева, развития кроны, величины урожая, длины шишек.
У крупносемянных форм имеются шишки различной длины. Поэтому их визуальный отбор затруднен. Фенотипический показатель крупносемянности — широкие шишки шаровидной или широкоовальной формы, с крупными, широкими утолщенными семенными чешуями.
Крупносемянные формы чаще встречаются в оптимальных условиях произрастания кедра сибирского — в черневом и горно-таежном поясах Северо-Восточного Алтая, в низкогорье Саян. Здесь ширина шишек равняется 5,5-6 см. В них содержится 65-75 крупных семян (длина 12-14, ширина 9-11 мм) общей массой 21-25 г. Масса 100 шт. полнозернистых семян колеблется в пределах 280-400 г (при влажности 10-12%).
Отбор крупношишечных и крупносемянных форм предпочтительнее проводить в высокоурожайные годы, когда наиболее полно реализуются потенциальные возможности генотипа, шишки достигают максимальных размеров и в них формируется наибольшее количество нормально развитых семян.
При отборе плюсовых деревьев на общую семенную продуктивность и товарность кедровых орехов важно учитывать сроки созревания и опада шишек. Это позволяет повысить их хозяйственный сбор на орехопродуктивных плантациях. Раннеспелые и позднеспелые особи определяются по прямому признаку: спелые шишки опадают при слабом сотрясении ветвей ветром или человеком.
У раннеспелых деревьев шишки созревают и опадают на 1-3 недели раньше, чем у типичных, среднеспелых кедров популяции. В низкогорных и южно-таежных кедровниках Сибири — обычно в середине августа, в среднегорье и среднетаежной подзоне — в конце августа—начале сентября. У позднеспелых особей созревание и опад шишек происходит на 1-3 недели позже, чем у обычных деревьев. В соответствующих лесорастительных условиях — в середине сентября — начале октября. В отдельные, неблагоприятные для созревания семян годы, шишки у позднеспелой формы и части среднеспелых деревьев остаются на побегах вплоть до февраля — апреля следующего года.