Для получения гибридов с нужным сочетанием хозяйственно полезных признаков создают много комбинаций и в каждой из них отбирают большое число растений.
В Международном селекционном центре по улучшению пшеницы и кукурузы (Мексика) ученый Н. Борлауг ежегодно проводит до 5000 комбинаций скрещиваний пшеницы. В селекционном центре Донского НИИСХ при работе с озимой пшеницей каждый год ведут скрещивания по 400—500 комбинациям, кастрируя и опыляя в каждой из них 15— 20 колосьев. Отбор проводят в F2 и затем в селекционных питомниках F3—F6 прорабатывают до 50 тыс. гибридных линий. В Краснодарском НИИСХ по той же культуре также ежегодно проводятся скрещивания в очень большом числе комбинаций. В каждой комбинации кастрируют 100—200 колосьев (2000—4000 цветков), чтобы в первом поколении иметь сотни, а во втором — сотни тысяч растений. Такой большой масштаб работы позволяет проводить индивидуальные отборы растений с нужным сочетанием хозяйственно полезных признаков, начиная со второго-третьего поколений. В каждой комбинации из F2—F3 закладывают тысячу и более линий, а в некоторых наиболее ценных комбинациях — более 4000 линий. Всего в селекционном питомнике высевают 10—25 тыс. гибридных линий. Здесь в одной комбинации отбирают 3—5 лучших линий, размножаемых до конкурсного сортоиспытания без отборов. В последующем по результатам конкурсного сортоиспытания в выделившихся наиболее ценных линиях проводят индивидуально-групповые отборы. Такой метод работы с гибридными поколениями позволяет на самых ранних стадиях селекционного процесса выделять лучшие линии и дает возможность организовать быстрое их размножение. При этом новые сорта отбирают как из ранних, так и из старших поколений.
Перекрестноопыляющиеся культуры чаще всего скрещивают путем ограниченно свободного или свободного опыления.