В борьбе с вирусными болезнями растений, возбудители которых внутриклеточные паразиты, наибольшее значение имеют профилактические мероприятия.
Они направлены на предохранение посевов от занесения вирусной инфекции, приостановление распространения болезни на посеве, если она была занесена, оздоровление посевного и посадочного материала. Осуществление этих мероприятий возможно обычными приемами агротехники и селекции.
Простой агротехнический прием, как выбор соответствующих сроков посева или посадка, дает значительное снижение вирусных болезней. В борьбе с вирусными болезнями картофеля в условиях юга и юго-востока решающее значение имеет ранняя посадка продовольственного картофеля. Ранние сроки предохраняют картофель от столбурного увядания и некоторых других вирусных болезней.
Густота посева также сильно влияет на поражение растений. Известны многочисленные примеры, когда вирусные болезни сильнее поражают изреженные посевы, чем нормальные или загущенные. Это установлено для закукливания овса, столбура томатов, курчавости листьев хлопчатника и других вирусных болезней.
Некоторые агротехнические приемы, непосредственно воздействующие на насекомых-переносчиков, снижают поражаемость растений вирусными болезнями. Например, глубокая зяблевая вспашка вызывает массовую гибель темной цикады, которая переносит вирус закукливания.
Кроме закукливания, большинство других вирусных болезней растений распространяется насекомыми, поэтому проведение борьбы с насекомыми-переносчиками (тлями, цикадами) имеет большое значение для полевых, огородных и плодово-ягодных культур.
Отбор, оздоровление и применение для посева заведомо чистого посевного или посадочного материала, происходящего от незараженных растений, имеют большое значение в борьбе с вирусными болезнями. Для этого в семеноводстве картофеля практическое значение имеет удаление больных растений при их появлении с поля (противовирусная прополка). При сильном заражении поля следует производить покустный отбор для получения здоровых семенных клубней.
Оздоровление семенного материала в некоторых случаях может быть достигнуто химическим протравливанием или термическим обеззараживанием семян (в борьбе с вирусными болезнями табака).
Наиболее радикальным средством борьбы с вирусными болезнями является введение в культуру устойчивых сортов.
Во Всесоюзном селекционно-генетическом институте выведен сорт картофеля Одесский-24, устойчивый к морщинистой мозаике. По данным С. Е. Грушевого, сорт махорки Высокорослая зеленая-317 и Эгиза-1549 устойчивы к вирусному заболеванию — верхушечному хлорозу.
Профессор Терновский М. Ф. методом половой гибридизации вывел высококачественные сорта курительного табака — Трапезойды-295, 288, 36, устойчивые к черной корневой гнили и иммунные к табачной мозаике. Профессор Московец С. Н. отмечает большую устойчивость некоторых сортов и гибридов сои к мозаике: Кировоградская-4, Староукраинская местная и др. Большие успехи достигнуты в выведении сортов хлопчатника, устойчивых к вирусным болезням.
Снижение вирусных болезней достигается тщательным искоренением сорняков, которые для многих вирусов являются естественным рассадником.