Основным методом исследования наследственности и изменчивости организмов является генетический анализ. Генетический анализ включает в себя ряд частных методов исследования.
Систему скрещиваний в ряду поколений, дающую возможность при половом размножении анализировать наследование отдельных свойств и признаков организмов, а также обнаруживать возникновение наследственных изменений, называют гибридологическим анализом. Гибридологический анализ является основным и специфическим методом генетики. Часто он включает в себя элементы математической статистики, поскольку его проводят на выборке особей или клеток. Кроме того, в генетический анализ входят рекомбинационный, мутационный и популяционный методы. Следует особо отметить метод селективных сред, позволяющий выявлять биохимические мутации.
Процесс материальной преемственности в поколениях отдельных клеток и организмов изучают с помощью цитологического метода. Можно сказать, что этот метод служит для исследования «анатомии» наследственности. Изучение структуры клетки ведут с помощью световой, электронной и фазовоконтрастной микроскопии, рентгеноскопии и других приемов. Для анализа материальных основ наследственности — функционирования хромосом и механизмов их воспроизведения при клеточном делении — начинают все шире привлекаться цитохимические, биохимические, биофизические и физиологические методы. Цитологический метод, соединенный с генетическим, называют цитогенетическим методом изучения наследственности.
В результате выявления генетического значения нуклеопротеинов и особенно нуклеиновых кислот (дезоксирибонуклеиновой кислоты — ДНК и рибонуклеиновой кислоты — РНК) открыт новый метод молекулярного анализа структуры и функционирования гена, а также гибридизации молекул ДНК.
Действие гена и его проявление в индивидуальном развитии организма изучают феногенетическим методом, который нам представляется правильнее называть онтогенетическим. Его составляют самые различные приемы анализа действия генов в клетке: трансплантация наследственно различных тканей, пересадка ядер из одной клетки в другую, методы культуры тканей с получением клонов из одиночных соматических клеток животного и растительного организмов. Действие генов изучают также с помощью различных мутаций, блокирующих определенные цепи биосинтеза и морфогенеза.
Так как клеточное деление и репродукция элементов клетки осуществляются на основе разнообразных физиологических, химических и физических процессов, то анализ этих тонких генетических явлений ведут с помощью новейших методов различных отраслей естествознания, в; особенности биохимии. Но для генетики все привлекаемые методы других дисциплин являются вспомогательными к основному, а именно — генетическому анализу.
Важно помнить, что генетический анализ необходимо постоянно расширять и углублять, ибо научное познание совершенствуется лишь с помощью новых методов.