Неокрашенные препараты. Их готовят для того, чтобы наблюдать за живыми микроорганизмами, определить наличие у них подвижности.
На чистое предметное стекло наносят каплю физиологического раствора. В каплю вносят предварительно обожженной и охлажденной иглой небольшое количество культуры исследуемого микроба (из колонии) и тщательно перемешивают; если исследуют жидкую культуру, то ее вносят каплей непосредственно на стекло. Препарат покрывают покровным стеклом. Неокрашенные препараты рассматривают с объективом 40 и окуляром 10х или 15х при затемненном поле зрения. Подвижность микробов лучше всего наблюдать в суточных бульонных культурах.
Окрашенные препараты. Их готовят для того, чтобы рассмотреть форму и в некоторых случаях строение микроорганизмов. На чистое предметное стекло наносят петлей небольшую каплю исследуемого материала и распределяют на площади около 1 см2. При исследовании творога и творожных изделий на стекло наносят петлей каплю физиологического раствора, вводят в нее петлей немного продукта, тщательно перемешивают и распределяют на площади около 1 см2. Препарат высушивают при температуре 18—20 °С, фиксируют, пронося несколько раз мазком вверх через пламя горелки, и красят метиленовым голубым в течение 0,5—1 мин. Краску смывают водой и препарат высушивают. Окрашенные препараты чаще всего рассматривают с иммерсионной системой. Для этого препарат помешают на предметный столик, закрепляют клеммами или препаратодержателем и на мазок наносят каплю кедрового масла. Полностью открыв диафрагму и подняв конденсор до уровня предметного столики, устанавливают максимальное освещение. Затем, глядя сбоку, с помощью кремальеры опускают тубус микроскопа вниз до соприкосновения объектива с маслом и слегка раздавливают его каплю. При этом объектив почти касается предметного стекла. Затем с помощью кремальеры, смотря в окуляр, поднимают тубус до тех пор, пока не появится окрашенный фон. После этого микрометрическим винтом устанавливают нужную резкость препарата.
Изучение свойств выделенных неизвестных микроорганизмов. При этом исследуют их морфологические, культуральные и физиологические свойства.
Морфологические признаки изучают, наблюдая под микроскопом форму клеток, их подвижность, наличие или отсутствие спор, жгутиков и пр.
Культуральные признаки изучают по характеру роста микробов на питательных средах. Исследуют особенности роста микроорганизмов на плотных питательных средах, при посеве штрихом, уколом, характер, величину, цвет колоний при посеве на чашки Петри, характер роста в жидкой питательной среде — бульоне.
Физиологические признаки характеризуют следующее: отношение микробов к температуре (оптимальная, минимальная и максимальная точки); изменения, вызываемые в молоке (способность к свертыванию с образованием кислоты и без нее, характер сгустка, предельная кислотность, способность к разложению белков молока); способность к сбраживанию углеводов (с образованием кислоты, газа); отношение к кислороду (рост при посеве уколом) и т. д.
Установить принадлежность микроорганизма к тому или тому виду очень сложно. Часто это исследование занимает много времени.