Для обнаружения вируса чаще всего используют экспресс-методы, которые позволяют в материале:
1) обнаружить вирусные белки (антигены). Для этой цели используют серологические реакции: РИФ, ИФА, РНГА, РСК, РДО;
2) обнаружить вирусные нуклеиновые кислоты с помощью полимеразной цепной реакции (ПЦР) или ДНК-зонда;
3) обнаружить вирионы вирусов. Электронная микроскопия позволяет обнаружить вирусы любых размеров, а крупные вирусы (вирусы оспы) можно увидеть под световым микроскопом. Этот метод называется вирусоскопия.
Электронная микроскопия используется в основном в исследовательских целях. Электронный микроскоп — сложный и дорогой прибор, в диагностических ветеринарных лабораториях его нет. Хотя исследование с его помощью — очень эффективный экспресс-метод при диагностике рота-, коронавирусных и других инфекций. Если в материале содержится не менее 107 вирионов на 1 мл, он не требует дополнительных методов очистки и концентрации;
4) обнаружить тельца-включения под световым или люминесцентным микроскопом.
Тельца-включения — это внутриклеточные включения, образующиеся в клетках при репродукции в них некоторых вирусов. По природе они представляют собой либо скопления (колонии) вирионов, либо измененный под действием вируса клеточный материал, либо комбинацию первого со вторым. Тельца-включения могут находиться в цитоплазме (чаще это РНК-содержащие вирусы) или в ядре (чаще это ДНК-содержащие вирусы, кроме вируса оспы), или в цитоплазме и ядре клетки (вирус чумы собак). Тельца-включения, образуемые некоторыми вирусами, получили специальное название, так, тельца-включения при оспе кур называются тельцами Боллингера, при чуме плотоядных — Ленца, при бешенстве — Бабеша—Негри и др. При обнаружении телец Бабеша—Негри в мазках головного мозга погибшего животного наличие бешенства считается доказанным. При других вирусных инфекциях обнаружение телец-включений имеет лишь вспомогательное диагностическое значение;
5) обнаружить вирусные гемагглютинины, которые являются белками некоторых вирусов (орто-, парамиксовирусов и др.).
Гемагглютинирующие вирусы способны агглютинировать эритроциты животных определенных видов в условиях соответствующих температуры и pH среды. Иногда используют реакцию гемагглютинации (РГА) для обнаружения гемагглютинирующего вируса в материале;
6) для обнаружения вируса в активной форме (инфекционной) используют довольно длительные вирусологические исследования. С этой целью применяют метод биопробы на живых чувствительных к предполагаемому вирусу системах: лабораторных животных, куриных эмбрионах, культурах клеток. В редких случаях приходится использовать естественно восприимчивых животных.