Обсуждая морфологию хромосом, Родс указал, что десять хромосом кукурузы, составляющие ее гаплоидный набор, морфологически различаются:
- относительной длиной;
- характерным хромомерным рисунком;
- наличием и расположением сильно окрашивающихся вздутий;
- положением центромеры (определяющим соотношение плеч);
- степенью гетеропикноза хромомер, прилегающих к центромере.
Эти диагностические признаки наиболее ясно видимы в пахинеме, когда хромосомы обнаруживаются в виде удлиненных парных нитей; именно эта стадия широко используется в цитогенетических исследованиях.
Моком и Фреем был найден показатель, позволяющий определять стадию мейоза без повреждения части метелки кукурузы. Они определяли связь стадии мейоза с морфологическими измерениями, включающими число развернувшихся листьев, число дней после прорастания, высоту растения и диаметр стебля. Число развернувшихся листьев оказалось лучшим показателем стадий мейоза, чем число дней после прорастания, высота растения или диаметр стебля. Число листьев, связанное с данной стадией мейоза, колебалось в зависимости от генотипа и внешней среды, но в пределах отдельных сочетаний генотип — внешняя среда коэффициенты корреляции варьировали от 0,73 до 0,89. У кукурузы число листьев было надежным показателем стадии мейоза. Использование этого показателя ограничено генетически однородными популяциями.