На дне этого океана различаются следующие крупные морфоструктурные области.
Океанический бассейн Бофорта, представляющий собой погруженную структуру Гиперборейской платформы. Возможно, что со стороны Аляски в краевую его часть погрузились структуры, образовавшие мезозойский краевой прогиб, выраженный понижением дна с глубинами до 4683 м. В рельефе дна, изученном недостаточно, намечается система поднятий глыбового характера. Подводные долины на материковом склоне указывают на молодые погружения, вызванные деформациями типа материковой флексуры, осложненными в отдельных местах разрывными нарушениями.
Океанические хребты Менделеева и Ломоносова, а также котловина Макарова — наиболее молодые из погрузившихся морфоструктур Арктического бассейна. Для складчатого хребта Ломоносова наиболее обоснованной представляется его структурная связь с мезозойскими складчатыми структурами Верхоянского хребта. Возраст хребта Менделеева должен быть старше. Он находится на возможном продолжении палеозойских складчатых структур Чукотского полуострова, переработанных мезозойскими и альпийскими движениями. Возможно, что хребет Менделеева образован палеозойской складчатостью и служит связующим звеном между структурами северо-востока Азии и Канадского Арктического архипелага. В этом случае Гиперборейская платформа оказывается окаймленной складчатыми поясами все возрастающей молодости, что свойственно и многим материковым платформам. Котловина Макарова может рассматриваться как межгорная впадина между двумя названными складчатыми поясами. Сопоставление разнообразных фактических данных по четвертичной геологии и палеогеографии указывает на возможность недавнего — голоценового погружения хребта Ломоносова. О молодости этих движений свидетельствуют и современная сейсмическая активность, а также вулканическая деятельность).
Океанический бассейн Нансена имеет наиболее сложно расчлененный рельеф дна, что находит объяснение в связи морфоструктур этого бассейна с погруженным фундаментом палеозойской платформы (на поверхности верхнепалеозойского складчатого фундамента). Морфологические контрасты здесь могут быть связаны с тектоническим расчленением фундамента. Кроме того, отдельные резко поднимающиеся подводные возвышенности, вероятно, представляют формы вулканического рельефа, который здесь подобно бассейну Скандик должен быть широко распространен. Материковый склон бассейна Нансена отличается резким и глубоким расчленением, в котором видное место занимают подводные каньоны явно тектонического происхождения. Благодаря их распространению материковый склон имеет глыбовый характер расчленения. Сейсмическая активность в зоне материкового склона указывает на тектонические движения по линиям разломов в настоящее время. В то же время она подчеркивает молодость образования океанической котловины Нансена.
Океанический бассейн Скандик, состоящий из котловин Гренландского и Норвежского морей, разделяемых подводным порогом Мона, имеет в основании древнюю платформу, погрузившуюся до больших глубин в третично-четвертичное время. Крутизна склонов, ограничивающих Скандик, свидетельствует об их тектонической природе. Скандинавский материковый склон сложно расчленен сбросами с неравномерным перемещением по ним отдельных блоков. У берегов восточной Гренландии известна материковая флексура, уходящая под материковым склоном на большую глубину. Фундамент платформы бассейна Скандик подвергся разрывным дислокациям с излиянием в третичное время базальтов, занимающих большие площади дна и побережий окружающей суши.
Материковая отмель. Одной из характерных черт морфотектоники Северного Ледовитого океана является большая ширина шельфа. Этот шельф приурочен к платформенным структурам различного возрастает древних платформ Баренцева и Карского моря до молодой — альпийской платформы Восточно-Сибирского и Чукотского морей. На шельфе выделяются формы рельефа различного происхождения — тектонически обусловленные впадины и желоба, унаследованные формы наземного происхождения (ледниковые, эрозионные, денудационные), морские формы современного образования.
Общие закономерности морфоструктуры Северного Ледовитого океана можно охарактеризовать следующим образом. Подобно Атлантике Северному Ледовитому океану свойственны отдельные котловины (бассейны), разделенные подводными хребтами. На эту морфологическую особенность впервые обратил внимание Ф. Нансен. Океанические бассейны образовались на месте погружения платформенных структур допалеозойского и палеозойского возраста. Подводные хребты имеют более молодой возраст. Одни из них представляют складчатые образования, связывающие материковые структуры Евразии и Северной Америки, другие — глыбовые структуры. Примером последних служит порог Мона в бассейне Скандик. В морфотектонике Северного Ледовитого океана, как и Атлантического, отчетливо проявляется диагональная система разломов планетарного масштаба. Они имеют направление СЗ—ЮВ и СВ—ЮЗ. Конфигурация Арктического бассейна и крупные черты его морфоструктуры определяются линиями указанных направлений.