В настоящее время принята унифицированная номенклатура инвазионных болезней, которые обозначаются по зоологическому наименованию рода возбудителя.
Впервые научную номенклатуру инвазионных болезней ввели К. И. Скрябин и Р. С. Шульц в 1928 г. в отношении гельминтозов, предложив при наименовании каждой болезни исходить из родового названия возбудителя с прибавлением к корню суффикса «оз» или «ез». Каждый вид, как известно, имеет двойное название: родовое и видовое, например Opisthorchis felineus, Fasciola hepatica; таким образом, заболевание, вызываемое ими, следует именовать описторхоз, фасциолез. В дальнейшем при обозначении гельминтозов, возбудителями которых являются не один, а несколько видов одного и того же рода, название болезни стали писать во множественном числе. Например, в тех районах, где у одного и того же животного встречаются оба вида фасциол (F. hepatica и F. gigantica), заболевание следует именовать как фасциолезы, а если у животных паразитируют одновременно Moniezia expansa и М. benedeni, — мониезиозы.
При необходимости можно применять также общие групповые обозначения для гельминтозов, вызываемых представителями определенных классов (трематодозы, цестодозы, нематодозы), отрядов или семейств. Например, стронгилятозы лошадей — это групповое обозначение гельминтозов, вызываемых целым рядом представителей подотряда Strongylata, или тениидозы плотоядных, обусловливаются множеством видов различных родов семейства Taeniidae.
Кроме того, вошло в широкую практику именовать гельминтоза, возбудители которых являются личиночными стадиями цестод по названию ларвоцист. Например, цистицеркоз свиней, возбудителем которого является личиночная стадия Cysticercus cellulosae, как цистицеркоз целлюлозный, равным образом ценуроз церебральный (Goenurus cerebralis) и др.
Ранее гельминтозы назывались по локализации гельминта в организме хозяина (печеночно-глистная, легочно-глистная болезнь и т. д.) либо по одному из характерных симптомов заболевания («вертячка», «сечение»), что создавало путаницу, лишало возможности правильно диагностировать болезнь. Действительно, что обозначает печеночно-глистная болезнь? Ничего. Дело в том, что у овец в печени могут паразитировать трематоды (фасциолы и дикроцелии), различные личиночные стадии цестод (эхинококк, альвеококк, цистицерки), и каждый из этих паразитов вызывает самостоятельное заболевание. Естественно, что комплекс профилактических мероприятий, применяемых, например, в отношении фасциолеза, совершенно неприемлем для борьбы с эхинококкозом.
Аналогичное название заболеваний введено К. И. Скрябиным и в арахноэнтомологию, где вместо термина «чесотка» употребляются псороптозы, демодекоз, а «оводовые болезни» именуются в настоящее время как гастрофилезы, эстроз, гиподерматозы, в соответствии с родовым названием возбудителей Hypoderma, Oestrus, Gastrophylus.
Тот же принцип введен и в протозоологию, например Nuttallia equi является возбудителем нутталлиоза лошадей, a Babesia bovis — бабезиоза крупного рогатого окота.