Оценка вредоносности, однако, представляет большую трудность для специалистов.
Простое сравнение урожая поврежденных и неповрежденных растений дает весьма неопределенные результаты. Так, растения, поврежденные хлопковой совкой, нередко оказываются более продуктивными, чем неповрежденные. Причина такого явления в данном случае — не положительное влияние фитофага на растение, а, скорее всего, особенности поведения самок этого вида, которые для откладки яиц выбирают наиболее мощные растения.
Удалять вручную с растений всех вредящих фитофагов технически невозможно, кроме того, эта процедура приводит к уплотнению почвы в результате вытаптывания и снижению по этой причине урожая.
Можно устранить, конечно, на опытных растениях вообще всех насекомых с помощью пестицидов, но такая химобработка ведет к множеству побочных эффектов. Добавим, что пестициды могут влиять отрицательно и на само растение.
Как в теплицах, так и в садках, помещенных в поле, микроклимат существенно отличается от того, что имеет место в открытом пространстве. Поэтому сравнение урожая в таких замкнутых и открытых пространствах, т. е. при отсутствии и при наличии и вредителя некорректно.
Некоторые более или менее сходные эффекты можно получить при искусственном повреждении растений с помощью ножниц, подражая таким образом результатам питания листогрызущих насекомых, таких как колорадский жук, саранчевые, хлопковая совка. Однако повреждения листьев клубеньковыми долгоносиками наносят больший ущерб продукции, чем искусственные повреждения. Наоборот, при повреждении точки роста озимой мухой растение остается живым, а при искусственном её срезании растение может погибнуть.
Возможно ориентировочное определение вредоносности по энергетическим потребностям насекомых. Для этого измеряют количество съеденной пищи. Конечно, при этом надо учитывать также и отходы, которые по массе могут быть больше потребляемой пищи. В некоторых случаях взвешивание можно заменить определением площади листовой поверхности растения до и после питания фитофага.