При необходимости исследовать большое количество материала удобнее окрашивать пыльники ацетокармином. Препараты лучшего качества получаются из материала, зафиксированного по Ньюкомеру, так как при фиксации легче добиться равномерного уплощения протопласта клетки, а следовательно, наилучшего распределения хромосомных конфигураций в метафазной пластинке.
Освобожденные от колосковых и цветочных чешуй зафиксированные пыльники помещают в фарфоровый тигель с несколькими каплями ацетокармина. Тигель нагревают последовательно 5—7 раз над спиртовкой, не доводя ацетокармин до кипения и полного испарения. Накрывают тигель часовым стеклом и оставляют в нем материал не менее чем на 1 сут при комнатной температуре. Окрашенный материал можно оставлять в тигле под часовым стеклом в течение 2 нед, добавляя при частичном испарении несколько капель ацетокармина. Качество окраски при этом не ухудшается.
Для детального исследования конфигураций мейотических хромосом пыльники лучше окрашивать по Фёльгену. Освобожденные от колосковых и цветочных чешуй пыльники переносят из фиксатора в дистиллированную воду, затем их споласкивают в 1 н. растворе соляной кислоты и помещают в 50 %-ную соляную кислоту (от продажной) на 20 мин для гидролиза. После этого пыльники помещают в реактив Шиффа на 1—2 ч. Окрашенные хромосомы приобретают интенсивный фиолетовый цвет, а цитоплазма клетки остается бесцветной или с едва заметным розовым оттенком. Хромосомы кукурузы хорошо окрашиваются только по Фёльгену.