В результате значительного увеличения содержания бора в кормах у коров и овец в рубце уменьшается количество инфузорий и их подвижность, а также количество грибов, участвующих в переваримости кормов.
В желудке и кишечнике всех видов животных снижается активность многих ферментов, синтез белков, усиливается секреция слизи желудочными и кишечными железами, образуются продукты распада кормов и микроорганизмов (скатол, индол, амины, сероводород, аммиак и другие ядовитые вещества). Одновременно с этим уменьшаются выработка эритроцитов, синтез гемоглобина, нарушаются функции печени, почек и щитовидной железы, задерживается созревание яйцеклеток, снижается оплодотворяемость, возникает предрасположенность к развитию пневмоний, не активируются витамины В2 и B12, угнетается окисление адреналина, нарушаются многие обменные процессы, что способствует перерождению печени и почек. В организме задерживаются продукты обмена белков, понижается почечный порог к фосфору, прогрессирует интоксикация, нарушаются трофика головного мозга и его функции. Отмеченные отклонения приводят к тяжелому состоянию, а затем и летальному исходу.