Наиболее частый путь попадания фтора в организм животных — пероральный. Газообразные соединения фтора поступают в организм через дыхательные пути с вдыхаемым воздухом.
Попадая в желудок, фтор вступает в химическую реакцию с хлористоводородной (соляной) кислотой желудочного сока. Образуется фтористый водород, оказывающий раздражающее действие на слизистую желудочно-кишечного тракта. Под влиянием высоких концентраций фтористого водорода слизистая желудка и кишечника подвергается воспалению и даже некрозу.
Часть фтора, попавшего в пищеварительный канал или в дыхательные пути, всасывается в кровь. Находясь в крови, фтор связывает кальций, магний, фосфор, белки, ферменты (костную фосфатазу, холинэстеразу и др.). Нарушается минеральный обмен, особенно фосфорно-кальциевый и магниевый. Ионы кальция, магния и фосфора, соединяясь с фтором, выключаются из обменных реакций, и у животных развивается остеодистрофия. Под влиянием фтора угнетаются энзимные процессы и нарушается тканевое дыхание. Фтор вытесняет йод из метаболитов щитовидной железы. Изменяются гормональный статус организма, деятельность различных органов и систем. Возникают расстройства центральной и периферической нервной системы, пищеварения, кровообращения, дыхания. Снижается естественная резистентность организма. При длительном течении болезни возникают миокардоз, дистрофия печени, нефроз, истощение.