Для замены песка при пользовании методами П и НП можно применять почву или искусственный компост, хотя обычно их гораздо труднее стандартизировать, в связи с чем возможна более, сильная изменчивость результатов. Однако этот субстрат используют для Подтверждения оценки проростков в сомнительных случаях и для анализа испытания образцов семян, из которых при проращивании на бумаге или на песке развиваются ростки с симптомами фитотоксикозов.
Почва должна быть хорошего качества, например садовый суглинок, просеянный для удаления крупных частиц. Она не должна сплываться, а если содержит глину, которая будет вызывать слипание, к ней нужно добавить песок. В случае необходимости почву перед употреблением нужно стерилизовать, чтобы убить бактерии, грибы, споры, нематоды или чуждые семена.
Воду нужно добавлять до тех пор, пока не будет достигнута такая консистенция почвы, при которой комок, образующийся при сжимании ее в горсть, будет легко распадаться при сдавливании между двумя пальцами. Когда почва увлажнится, ее нужно протереть сквозь сито и засыпать, не уплотняя, в посуду для проращивания семян.