Характерный признак подкласса — зигогамный половой процесс с образованием покоящихся спор зигоспор и бесполое размножение неподвижными спорами, образующимися эндогенно в спорангиях, или у некоторых — конидиями.
Зооспоры никогда не образуются, и весь подкласс может быть охарактеризован как безжгутиковый ряд класса фикомицетов (Aciliata).
Все зигомицеты объединяют в пять порядков, из которых лучше изучены и наиболее распространены представители двух порядков: мукоровых (Mucorales) и энтомофторовых (Entomophthorales).