Уяснение (на базе анализа взаимодействия материальных, энергетических и информационных потоков) того, как окружающая среда и суперсистема видоизменяют структуру и функции агроэкосистемы, имеет и теоретическую, и практическую ценность.
Ученые-агробиологи, выполняющие прикладное исследование, стыкующееся непосредственно с проектной деятельностью, стремятся побольше узнать о том, как функционирует фермерская система. Ученые-агробиологи, выполняющие теоретическое исследование, заинтересованы в выявлении общих принципов, которые помогли бы повысить эффективность прикладного исследования.
Экологи часто формулируют концепцию агроэкосистемы как естественной экосистемы, «разрушенной» и «приведенной в упадок» человеком. При этом обычно упускают из виду факт, что, поскольку в экосистемах обработка информации сконцентрирована вокруг одного вида, они могут служить идеальным объектом для изучения информационных процессов в экосистемах вообще. Формирование теоретической основы информационных процессов в агроэкосистемах внесет свой вклад также и в теоретическое осмысление естественных агроэкосистем. Практические и теоретические предпосылки для формулировки концепции агроэкосистемы в терминах детерминантов-решений обсуждаются ниже.