В итоге обширных почвенно-альгологических исследований сложилось представление, что водоросли играют положительную роль в создании и поддержании плодородия почвы.
Такое убеждение послужило основой для попыток усилить развитие водорослей путем искусственного внесения их в почву или путем стимуляции автохтонной альгофлоры. Вместе с тем быстрота роста водорослей, зависимость его от многих внешних факторов и сходство водорослей с высшими растениями по реакции на эти факторы привели к мысли о возможности использования водорослей для диагностики состояния почвы.
Таким образом, намечаются три направления практического использования почвенных водорослей: 1) искусственное внесение живых культур водорослей в почву — до посева растений, при посеве вместе с семенами или после посева, что оказалось эффективным приемом повышения урожая риса; 2) регулирование развития почвенной альгофлоры с целью усиления полезных, например азотфиксирующих, видов и подавления вредных, например зеленых, водорослей на рисовых полях в первые периоды развития риса; 3) применение водорослей в качестве биологических индикаторов при оценке плодородия почвы и определении потребности почвы в удобрениях.