Во время досмотра подкарантинных материалов и объектов государственный инспектор по карантину растений проверяет их фитосанитарное состояние, осматривает и отбирает пробы и средний образец, собирает поврежденные либо подозрительные растения и растительные продукты, направляет их в карантинную лабораторию для проведения фитосанитарной экспертизы.
В случае складирования, концентрации (накопления) и сортирования в морских и речных портах, на железнодорожных станциях, автостанциях, и в других терминалах, проводится вторичный карантинный досмотр подкарантинных материалов и объектов.
После обеззараживания подкарантинных материалов и объектов окончательный вывод относительно карантинного состояния партии груза делает государственный инспектор по карантину растений на основе результатов повторного досмотра и фитосанитарной экспертизы.