Революционным направлением является разработка вакцин на основе трансгенных растений, в геном которых был встроен фрагмент генома патогенного микроорганизма или вируса.
Экспериментальные данные свидетельствуют о широкой перспективе в разработке и практическом использовании таких вакцин. В 1998 г. на картофеле, который продуцировал В-субъединицу холерного анатоксина, была получена выраженная защита у поедавших его мышей при заражении их холерой. Аналогичная вакцина против кори была получена на табаке. Сейчас с обнадеживающими результатами испытываются «картофельные» вакцины к вирусу Ньюарк (возбудителю диареи) и гепатиту В. На животных исследуют выращенные на помидорах вакцины против бешенства.