Там, где сельскохозяйственные системы зависят от погодных условий и на их продуктивность оказывают большое воздействие деятельность человека, топография и климат, каждая ферма по основным характеристикам может быть уникальной.
С другой стороны, на современных птицефермах условия окружающей среды тщательно контролируются, продуктивность земель не имеет значения (хотя могут возникнуть проблемы использования отходов и птичьего помета) и высокая степень автоматизации производственных процессов может в значительной степени снизить зависимость выхода продукции от квалификации человека. В таких случаях индивидуальные различия могут иметь второстепенное значение и одна модель имеет достаточно широкую область применения независимо от ее места расположения и масштабов. Однако там, где индивидуальные различия являются существенными, и особенно там, где на продуктивность систем оказывают большое влияние опыт фермеров и квалификация управляющих, модели общего характера имеют довольно ограниченное применение.
Интересная параллель существует между фермами и живыми организмами. Например, животные характеризуются индивидуальной реакцией относительно таких факторов, как климат, но возникли они на Земле группами, которые можно классифицировать. Развитие примитивных сельскохозяйственных систем происходило аналогичным образом, и в настоящее время не существуют их неудачных вариантов. Однако товарные сельскохозяйственные системы должны изменяться в соответствии с «экономическим климатом», который, в свою очередь, может меняться очень быстро и противоположным образом. Более того, в то время как животное во многом похоже на своих родителей и воздействие климата на него проявляется относительно медленно, фермы могут подвергаться радикальным изменениям, как с точки зрения производимой продукции, так и масштабов и способны существовать в большом числе промежуточных форм. Например, существуют фермы, на которых содержат не только крупный рогатый скот или овец, а также фермы, на которых выращивают тех и других в самых различных пропорциях. Классификация сельскохозяйственных систем имеет большое значение. В противоположном случае было бы невозможно определить, к какой системе относятся результаты какого-нибудь одного исследования. Однако нельзя подразделять системы так отчетливо, как классифицируются животные или растения. За исключением более стандартизированных интенсивных систем с хорошим контролем за условиями окружающей среды между отдельными фермами наблюдаются существенные различия. Однако они часто не превышают изменений, характерных для одной и той же фермы по годам, а иногда имеют такую же величину, как эти изменения. Например, годовые колебания урожайности в зависимости от погодных условий на одной и той же ферме и изменение урожайности для различных ферм в зависимости от топографических условий и уровня организации сельскохозяйственного производства. В одной и той же модели эти различия поддаются учету. Однако при структурных различиях систем, существующих между фермами по выращиванию овец и свиней и крупного рогатого скота и овец, сама модель будет иной, включающей совсем другие взаимосвязи. В этом случае создание моделей более затруднительно, однако это не означает, что модели для таких ситуаций не нужны.