Значительная часть цитокиновых рецепторов, в частности рецепторы интерферонов, используют так называемый JAK-STAT-сигнальный каскад.
Имеется 4 вида тирозиновых белок-киназ семейства JAK (только одна из них, JAK3, экспрессируется преимущественно в клетках иммунной системы, остальные экспрессируются во всех типах клеток) и 7 субъединиц транскрипционных факторов семейства STAT. JAK-киназы конститутивно рекрутированы на внутриклеточные домены рецепторов, причем до связывания цитокина с рецептором они сами не фосфорилированы. После активации рецепторов киназы (предположительно сидящие на отдельных цепях рецепторного комплекса) сближаются, активируются (по принципу «активации, индуцированной близостью» — proximity-induced activation) и фосфорилируют друг друга, а также тирозиновые остатки в цитоплазматических доменах рецепторов. На измененную в результате этих модификаций платформу рекрутируются молекулы-прсдшсственники транскрипционных факторов семейства STAT, которые сами по себе не активны. На активированной рецепторно-киназной платформе они фосфорилируются по тирозиновым остаткам киназами JAK, причем после фосфорилирования они теряют сродство к рецепторнокиназному комплексу, но приобретают свойство образовывать димеры. Именно такие димеры STAT-белков (в некоторых случаях – с присоединением еще одной белковой субъединицы) и становятся полноценными транскрипционными факторами — они транслоцируются в ядро и активируют гены, содержащие соответствующие регуляторные элементы в своих промоторах или энхансерах.