Различные виды растений обладают разным потенциалом рекомбинации при межвидовой и межродовой гибридизации.
В то же время именно интрогрессия, т. е. передача генетического материала от одного рода или вида другому, лежит в основе образования многих культурных видов растений, а также повышения эффективности адаптивной селекции. В результате взаимной интрогрессии (переопыление культурных и диких сорных форм) возникает и «мимикрия культур», т. е. большое фенотипическое сходство между ними. Результативность интрогрессивной селекции, как, впрочем, и трансгрессивной, определяется возможностями множественных обменов и характером их распределения по геному, вовлечением в кроссинговер «молчащих» (в рекомбинационном отношении) зон хромосом, степенью проявления квазисцепления, соотношением преобразовательных и воспроизводительных функций мейоза, постмейотической элиминацией рекомбинантных гамет и зигот и т. д.
При определении реальности селекционных задач, а также их приоритетов необходима оценка рекомбинационного потенциала вида в плане возможностей генетической изменчивости важнейших хозяйственно-ценных и адаптивно значимых признаков. Известно, например, что неудачи в селекции на высокую солеустойчивость сельскохозяйственных культур связаны, в первую очередь, с недостаточной генетической вариабельностью соответствующего признака у большинства высокопродуктивных видов растений. Из более полного понимания роли рекомбинационной системы в эволюции и окультуривании видов растений вытекают и новые подходы к сбору и хранению их генофонда, рассматриваемого в качестве постоянно эволюционирующей, т. е. динамичной системы. Это, в свою очередь, предполагает создание идентифицированных генетических коллекций не только по хозяйственноценным признакам, но и по функциональным компонентам рекомбинационной системы, контролирующим процессы формирования потенциальной, свободной и доступной отбору генотипической изменчивости.