Большое влияние оказывал на Борщова его учитель — альголог, систематик и географ растений академик Ф. И. Рупрехт (1814— 1870).
В опубликованном в 1866 г. классическом труде «Геоботанические исследования о черноземе» Рупрехт утверждает, что вопрос о черноземе — это ботанический вопрос. Все содержание этой работы доказывает правильность биологической теории почвообразовательного процесса, убедительно показывает роль растительного покрова в этом процессе. Рупрехт несомненно является предшественником Докучаева. Существенно и то, что Рупрехт первым в России применил понятие геоботаника. Спорным, однако, является, употреблял ли он этот термин в современном смысле. Так как это понятие и в настоящее время применяется очень различно, то ответить на этот вопрос трудно. В трактовке Рупрехта геоботаника — наука, которая изучает взаимные отношения растительного покрова и физико-географической среды. Очевидно, это не фитоценология, т. е. геоботаника в самом узком смысле. Если же рассматривать геоботанику как науку о растительном покрове (т. е. включающую не только фитоценологию), то Рупрехта надо оценить как дальновидного ученого, который по-новому взглянул на растительный покров и предсказал рождение новой науки, дав ей даже название.