Огурец посевной имеет типичное для всех тыквенных строение семени. Семя лишено эндосперма и состоит из прямого зародыша, заключенного в семенную кожуру. Нуцеллус и эндосперм сохраняются в виде остаточных слоев. Большую часть семени занимают крупные плоские семядоли зародыша, содержащие запасные питательные вещества.
Зародыш имеет короткую ось, обращенную корневым полюсом к микропиле; почечка и зародышевой корень занимают гораздо меньший по сравнению с семядолями объем.
Семенная кожура образуется только из наружного интегумента двупокровного семязачатка; внутренний интегумент разрушается уже на ранних стадиях развития семени. Наружная эпидерма наружного интегумента за счет периклинальных делений утолщается и дифференцируется на четыре хорошо различимых основных слоя: эпидерму, гиподерму, склеренхиму и паренхиму.
Эпидерма семенной кожуры однослойная и состоит из радиально удлиненных (палисадных) клеток, содержащих крахмал. Наружные и внутренние (тангентальные) стенки эпидермальных клеток утолщены; радиальные очень тонкие, но с характерными тяжами целлюлозных утолщений, которые тянутся от основания клетки и разветвляются по направлению к наружной, покрытой кутикулой оболочке. За эпидермой следует механическая ткань, представленная гиподермой и склеренхимой, придающими твердость семенной кожуре. Субэпидермальный слой (гиподерма) состоит из одного-двух рядов небольших тангентально удлиненных клеток с утолщенными слоистыми или инфицированными оболочками. Склеренхимный слой представлен одним рядом крупных склереид, сходных с каменистыми клетками (брахисклереидами), на плоских сторонах семени и двумя-тремя рядами на ребрах. Плотно сомкнутые склереидные клетки имеют равномерно утолщенные оболочки и узкую полость; оболочки клеток пронизаны поровыми каналами и характеризуются отчетливо различимой слоистостью. На ребрах семени из двух рядов склеренхимных клеток один составлен более короткими клетками. Паренхима состоит из нескольких рядов тонкостенных клеток, толщина ее колеблется от 6,5 до 50 мкм.
Непосредственно к эпидерме семядолей примыкают остатки нуцеллуса и эндосперма, толщина слоя которых соответственно 10-15 и 5-7 мкм. Семядоли имеют компактную дорсовентральную структуру. В недостаточно еще дифференцированном (однородном) мезофилле уже выделяются три ряда удлиненных с тонкими оболочками клеток палисадной паренхимы и несколько рядов плотной губчатой ткани. В жилках можно различить сосуды и флоэмные элементы.
Сорта огурца посевного имеют заметные различия, являются в толщине отдельных слоев семенной кожуры. Наибольшим изменениям подвержены механическая ткань и паренхима.