С определения систематического состава (в том числе видового или фаунистического) начинается всякое синэкологическое исследование.
Иногда выявляются лишь крупные таксоны — семейства, отряды, к которым и привязываются все прочие сведения. Чаще это связано с трудностями более детальной обработки. Но бывает целесообразно на отдельных этапах исследования анализировать структуру того или иного комплекса почвенных беспозвоночных на уровне надвидовых таксонов, например семейств, которые характеризуются весьма определенными экологическими особенностями. Это, в частности, применяется в тех случаях, когда исследователь имеет дело с группами, включающими очень большое число видов. Например, количество видов нематод, фиксируемых в отдельных биотопах, может достигать нескольких сотен, при этом многие виды близки экологически. Однако полная систематическая обработка, т. е. определение до вида, желательна во всех случаях, независимо от целей исследования. Это позволяет полнее использовать полученные данные для дальнейших анализов.
Понятия «фауна», «видовой состав» относятся к весьма различным категориям. Так, можно говорить о фауне конкретного участка, одного типа сообществ (фауна суходольных лугов, дубрав и т. д.), отдельного региона (включая все типы сообществ на его территории), зоны, страны и т. д. Нам представляется целесообразным конкретизировать понятия, отражающие видовой состав организмов, населяющих разные единицы среды. Во-первых, следует выделить понятие фауны, используемое в зоогеографии — совокупность видов разных групп животных, связанных общностью генезиса (фаунистические комплексы, типы фауны и др.). Эти понятия отражают связи генезиса фауны с определенной территорией. Почвенная фауна до сих пор очень мало использовалась в зоогеографических анализах, причина чего — трудность выявления и слабая изученность видового состава почвенных животных, а также тенденция к очень широкому распространению типичных почвенных форм. Последнее более свойственно самым мелким почвенным животным, тогда как среди крупных форм, например дождевых червей, имеется значительный процент эндемиков, От региональных фаунистических комплексов следует отличать типологические категории — зональные фауны, например фауну степной зоны, фауну лесостепи, тундры и т. д. В их пределах, в свою очередь, можно выделить фауны отдельных типов сообществ — собственно зональных или интразональных. В ботанике широко используется понятие «конкретной флоры». Это — полный список видов относительно небольшого района, включающего все наиболее характерные элементы ландшафта данной зоны. Есть основание ввести понятие «конкретной фауны» в практику почвенно-зоологических исследований. Это позволит более дифференцированно подойти к анализу систематического состава почвенных животных разных сообществ. Между отдельными категориями фауны существуют весьма определенные соотношения, закономерно меняющиеся в разных зонах. Приведем несколько примеров. С. И. Ананьева (1973) в одном районе Западного Таймыра обнаружила 62 вида коллембол. Были обследованы все основные биотопы, поэтому можно считать, что в данном случае мы имеем дело с весьма полной конкретной фауной. В отдельных зональных сообществах отмечалось 30—40 видов. Сравнение с данными по более южным зонам (Вызова, 1964; Солнцева, 1962; Стебаева, 1968) показывает, что данная конкретная фауна коллембол, а также фауны собственно зональных сообществ превосходят или немногим уступают таковым тайги, смешанных лесов и лесостепи. Между тем, бесспорно, общие фауны таежной зоны, а тем более смешанных лесов и лесостепи значительно богаче таковой Субарктики. Этот факт, вероятно, можно рассматривать как доказательство более равномерного распределения коллембол в тундровой зоне, меньшего развития экологического викариата и большей насыщенности коллемболами тундровых ценозов.